RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMCO6Q96DC7 493 aa25.91■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-210ENST00000574322 KLHDC3Q9BQ90 382 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-210ENST00000574322 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa25.91■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TACR3P29371 465 aa25.91■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-210ENST00000574322 FBXW4P57775 412 aa25.88■■□□□ 1.73
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CTDNEP1-210ENST00000574322 EXT1Q16394 746 aa25.88■■□□□ 1.73
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC22A8Q8TCC7 542 aa25.87■■□□□ 1.73
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CTDNEP1-210ENST00000574322 FBXO45P0C2W1 286 aa25.86■■□□□ 1.73
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ITGADQ13349 1161 aa25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1-210ENST00000574322 DOC2BQ14184 412 aa25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM69BQ5VUD6 431 aa25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1-210ENST00000574322 M1APQ8TC57 530 aa25.86■■□□□ 1.73
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