RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	VRK2	Q86Y07	508 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC103	Q8IW40	242 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	PIGX	Q8TBF5	258 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	GTF2H4	Q92759	462 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	APH1A	Q96BI3	265 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	MUCL1	Q96DR8	90 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	C18orf12	Q96KH6	178 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ADAM19	Q9H013	955 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	DLL4	Q9NR61	685 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	IFT52	Q9Y366	437 aa		8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	8.32	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ITPR3	Q14573	2671 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	HS3ST1	O14792	307 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	CLOCK	O15516	846 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	THBS1	P07996	1170 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	IMPDH2	P12268	514 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	GGT1	P19440	569 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHV1-2	P23083	117 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	EDNRA	P25101	427 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC16A1	P53985	500 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	AQP5	P55064	265 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	PPA1	Q15181	289 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	STK11	Q15831	433 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	TTMP	Q5BVD1	217 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479		Q5PR19	223 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	SSX8	Q7RTT4	187 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	HDX	Q7Z353	690 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	BIVM	Q86UB2	503 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	CADM2	Q8N3J6	435 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF611	Q8N823	705 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	PERP	Q96FX8	193 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM19	Q96HH6	336 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	EBF4	Q9BQW3	602 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ASB6	Q9NWX5	421 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	MED13L	Q71F56	2210 aa		8.31	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A096LPI6	279 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	CIB4	A0PJX0	185 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	DPRX	A6NFQ7	191 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	C5orf58	C9J3I9	102 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	RAMP1	O60894	148 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	TMCC2	O75069	709 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	PGM3	O95394	542 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHV3-9	P01782	118 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	GPI	P06744	558 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	INHBB	P09529	407 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	NUDT7	P0C024	238 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	NTF4	P34130	210 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	IDUA	P35475	653 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	FAP	Q12884	760 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	FADD	Q13158	208 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	CEACAM7	Q14002	265 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF220	Q5VTB9	566 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM225	Q6GV28	225 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	MAL2	Q969L2	176 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	SPDL1	Q96EA4	605 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	BDH2	Q9BUT1	245 aa		8.3	□□□□□ -1.08
KIFC3-231	ENST00000567479	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		8.3	□□□□□ -1.08

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