RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 TIGD3Q6B0B8 471 aa15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 BORAQ6PGQ7 559 aa15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR13C2Q8NGS9 318 aa15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR51A7Q8NH64 312 aa15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 OSTF1Q92882 214 aa15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 RELTQ969Z4 430 aa15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNAJA3Q96EY1 480 aa15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 NPAS1Q99742 590 aa15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 RASSF1Q9NS23 344 aa15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL20RAQ9UHF4 553 aa15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRAV27A0A087WT01 109 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A087WV48 116 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAGEA13PA6NCF6 341 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM8BA6NDV4 472 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRRN3E7EW58 273 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 BMP7P18075 431 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPS5P46782 204 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUP107P57740 925 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 ISL1P61371 349 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYBPC1Q00872 1141 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 CD47Q08722 323 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 CASP12Q6UXS9 341 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF620Q6ZNG0 422 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 DEPDC4Q8N2C3 294 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 IQCF1Q8N6M8 205 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 FANK1Q8TC84 345 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBE2FQ969M7 185 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 TSSK6Q9BXA6 273 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR52D1Q9H346 318 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL20Q9NYY1 176 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 DKKL1Q9UK85 242 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDH10Q9Y6N8 788 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGF2RP11717 2491 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A0G2JMM0 328 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1W2PPB8 328 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1W2PRS3 328 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 A8MVM7 634 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIR3DP1A8MWS1 328 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 E9PQ18 207 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 HCN1O60741 890 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 CBR3O75828 277 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR7A10O76100 309 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 RCBTB2O95199 551 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 LYNP07948 512 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 CD46P15529 392 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 DPP4P27487 766 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 ELK4P28324 431 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 GIPRP48546 466 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMSP52788 366 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC27A4Q6P1M0 643 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGFL2Q6UWQ7 119 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRRC17Q8N6Y2 441 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR52L1Q8NGH7 329 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR5M1Q8NGP8 315 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 MRGPRX4Q96LA9 322 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 SAMD8Q96LT4 415 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 C5orf34Q96MH7 638 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADNPQ9H2P0 1102 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 NANSQ9NR45 359 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLHL1Q9NR64 748 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 SERINC1Q9NRX5 453 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 AASSQ9UDR5 926 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHRNA9Q9UGM1 479 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 HTR3EA5X5Y0 456 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAF4O00268 1085 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNFAIP8O95379 198 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 HK1P19367 917 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZBED5Q49AG3 693 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLX4IPQ5VYV7 408 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 ENTHD1Q8IYW4 607 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR8D4Q8NGM9 314 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 CNIH3Q8TBE1 160 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 TM9SF4Q92544 642 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAAR8Q969N4 342 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 NTNG2Q96CW9 530 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 TEX12Q9BXU0 123 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 DEPPQ9NTK1 212 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 TVP23BQ9NYZ1 205 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF6Q9Y252 685 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 SIGLEC7Q9Y286 467 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYRFQ9Y2G1 1151 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF337Q9Y3M9 751 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A087WZY1 265 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms