RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528627.1

NSD3-208, Transcript of nuclear receptor binding SET domain protein 3, human

TSL 2

Gene NSD3, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSD3-208	ENST00000528627	KRT6A	P02538	564 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	PRG2	P13727	222 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	ZNF44	P15621	663 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	ANXA13	P27216	316 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	HTR1F	P30939	366 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	MEMO1	Q9Y316	297 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	IDS	B3KWA1	339 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	DCTN6	O00399	190 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	PFKFB2	O60825	505 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	MGMT	P16455	207 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	CALCR	P30988	508 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	EFNB2	P52799	333 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	NUP107	P57740	925 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	GRB7	Q14451	532 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	HIST1H4G	Q99525	98 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	TREM2	Q9NZC2	230 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	PTCH1	Q13635	1447 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	USP27X	A6NNY8	438 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	SCGN	O76038	276 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	HTR1E	P28566	365 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	GCA	P28676	217 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	CD1B	P29016	333 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	RFC4	P35249	363 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	CASP4	P49662	377 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	KLK7	P49862	253 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	CASC10	Q5T4H9	136 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	VSTM4	Q8IW00	320 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	COQ2	Q96H96	371 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	SEC22A	Q96IW7	307 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	RAB34	Q9BZG1	259 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	VCPKMT	Q9H867	229 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	COPS3	Q9UNS2	423 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627		V9GY05	133 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	CPLX1	O14810	134 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	STAMBP	O95630	424 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	AP2A1	O95782	977 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	HSMCR30	P0CW71	290 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	NPR2	P20594	1047 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	COX7A1	P24310	79 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	GRIA1	P42261	906 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	KRTAP12-2	P59991	146 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	SLC15A2	Q16348	729 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	RDH10	Q8IZV5	341 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	SLC34A3	Q8N130	599 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	FTMT	Q8N4E7	242 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	RNF138	Q8WVD3	245 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	NANOG	Q9H9S0	305 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	AIG1	Q9NVV5	245 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	PINLYP	A6NC86	204 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627		A8MUA0	341 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	GFY	I3L273	518 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	PRKAB2	O43741	272 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	NPIPB7	O75200	414 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	NR2C1	P13056	603 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	GLRA2	P23416	452 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	CCNE1	P24864	410 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	SHMT2	P34897	504 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	KIR2DS4	P43632	304 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	ASPH	Q12797	758 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	KLRB1	Q12918	225 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	ARFRP1	Q13795	201 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NSD3-208	ENST00000528627	PDK3	Q15120	406 aa		3.53	□□□□□ -1.84

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