RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636		A0A1W2PPV4	95 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636		A8MUI8	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636		H3BMM5	538 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	RGS10	O43665	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SNX3	O60493	162 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DCTN3	O75935	186 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CCNB2	O95067	398 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	VENTX	O95231	258 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CD160	O95971	181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	F10	P00742	488 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ADA	P00813	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	UMOD	P07911	640 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CHRM4	P08173	479 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PNMT	P11086	282 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TNNI3	P19429	210 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	IVD	P26440	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CD80	P33681	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ADRA1A	P35348	466 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SLCO1A2	P46721	670 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MARCKSL1	P49006	195 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CTSC	P53634	463 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	S100A12	P80511	92 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PRKAA1	Q13131	559 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	RAB43	Q86YS6	212 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	GPX8	Q8TED1	209 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ATL1	Q8WXF7	558 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	OSTF1	Q92882	214 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	HAUS1	Q96CS2	278 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TGM7	Q96PF1	710 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CNPY3	Q9BT09	278 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	DUSP16	Q9BY84	665 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	WDR76	Q9H967	626 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	KLHL1	Q9NR64	748 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636		A0A0D9SEW6	157 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636		A0A0U1RRA0	63 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	KMO	O15229	486 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MATN3	O15232	486 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	LDB2	O43679	373 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	MGRN1	O60291	552 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	FCMR	O60667	390 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SCRG1	O75711	98 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	SEMA3D	O95025	777 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	VNN1	O95497	513 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	ITGAM	P11215	1152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP3CB	P16298	524 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	CTRB1	P17538	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PABPC1-223	ENST00000523636	EDN2	P20800	178 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms