RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512656.1

USP46-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

TSL 3

Gene USP46, Length 467 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-208ENST00000512656 PTGR1Q14914 329 aa6.36□□□□□ -1.39
USP46-208ENST00000512656 PPA1Q15181 289 aa6.36□□□□□ -1.39
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USP46-208ENST00000512656 SMU1Q2TAY7 513 aa6.36□□□□□ -1.39
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USP46-208ENST00000512656 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
USP46-208ENST00000512656 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
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USP46-208ENST00000512656 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP46-208ENST00000512656 SULT2B1O00204 365 aa6.35□□□□□ -1.39
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USP46-208ENST00000512656 CRLF1O75462 422 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-208ENST00000512656 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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USP46-208ENST00000512656 REG4Q9BYZ8 158 aa6.35□□□□□ -1.39
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USP46-208ENST00000512656 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP46-208ENST00000512656 POLE3Q9NRF9 147 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-208ENST00000512656 ACER3Q9NUN7 267 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-208ENST00000512656 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
USP46-208ENST00000512656 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-208ENST00000512656 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-208ENST00000512656 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-208ENST00000512656 LIPT1Q9Y234 373 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-208ENST00000512656 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.35□□□□□ -1.39
USP46-208ENST00000512656 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.35□□□□□ -1.39
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