RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 A0A087WUU8 490 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 OR2W5A6NFC9 320 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 D6RAR5 112 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 WWP2O00308 870 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 SURF4O15260 269 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 LYRM1O43325 122 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 ALX3O95076 343 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 NKX2-2O95096 273 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 EPPINO95925 133 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 LIMS3P0CW19 117 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 LIMS4P0CW20 117 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 NT5EP21589 574 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 PAICSP22234 425 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 ALAS2P22557 587 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 OMPP47874 163 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 ID4P47928 161 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 EVX1P49640 407 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 PDX1P52945 283 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 ATP12AP54707 1039 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 FABP5Q01469 135 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 CHRNEQ04844 493 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 MAB21L1Q13394 359 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 IL18Q14116 193 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 IL11RAQ14626 422 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 DUSP5Q16690 384 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 TATDN3Q17R31 274 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 C6orf183Q5T699 404 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 AADACL4Q5VUY2 407 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF620Q6ZNG0 422 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF615Q8N8J6 731 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 CDRT4Q8N9R6 151 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF485Q8NCK3 441 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 RCBTB1Q8NDN9 531 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 OR52L1Q8NGH7 329 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 ADAMTS15Q8TE58 950 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 TM9SF4Q92544 642 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 TTC9Q92623 222 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 PMM1Q92871 262 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM203Q969S6 136 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 SDF2Q99470 211 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 ATF6BQ99941 703 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 MARVELD1Q9BSK0 173 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM43Q9BTV4 400 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 MMP28Q9H239 520 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 OCIAD1Q9NX40 245 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 IL20Q9NYY1 176 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 SATB2Q9UPW6 733 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM5Q9Y2B1 443 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 NOX1Q9Y5S8 564 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 GPR179Q6PRD1 2367 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 USP24Q9UPU5 2620 aa8.83□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 RP1P56715 2156 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 VSTM2BA6NLU5 285 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 GABRPO00591 440 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 FCMRO60667 390 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 TIAF1O95411 115 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 THBS1P07996 1170 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 CLEC2LP0C7M8 214 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 PSKH1P11801 424 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 MAOAP21397 527 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 CCKBRP32239 447 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 ATP6V1E1P36543 226 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 MC2RQ01718 297 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 STX4Q12846 297 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 FAPQ12884 760 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 TNK1Q13470 666 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 OR2G6Q5TZ20 316 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 HBMQ6B0K9 141 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 FRRS1Q6ZNA5 592 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 CREB3L2Q70SY1 520 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
POLR1A-208ENST00000486964 COMTD1Q86VU5 262 aa8.82□□□□□ -1
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