RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482232.1

GTF2I-208, Transcript of general transcription factor IIi, human

TSL 2

Gene GTF2I, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTF2I-208	ENST00000482232	LAMA1	P25391	3075 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	NRCAM	Q92823	1304 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	ZNF253	O75346	499 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	SERPINA3	P01011	423 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	LYN	P07948	512 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	SELPLG	Q14242	412 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	PDK3	Q15120	406 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	RCN1	Q15293	331 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	OR1C1	Q15619	314 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	CENPU	Q71F23	418 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	P3H4	Q92791	437 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	OSTF1	Q92882	214 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	VSTM2L	Q96N03	204 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	RANBP9	Q96S59	729 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	NLN	Q9BYT8	704 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	GDF3	Q9NR23	364 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	RNF14	Q9UBS8	474 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	PTPRB	P23467	1997 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	HIDE1	A8MVS5	230 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	WASH3P	C4AMC7	463 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	MED7	O43513	233 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	SDC3	O75056	442 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	ZNF806	P0C7X5	589 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	HNF1A	P20823	631 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	MGAT3	Q09327	533 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	PLD1	Q13393	1074 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	P2RY14	Q15391	338 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	TATDN3	Q17R31	274 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	REP15	Q6BDI9	236 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	GPBP1	Q86WP2	473 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	PARP8	Q8N3A8	854 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	PPTC7	Q8NI37	304 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	AGR3	Q8TD06	166 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	MIOX	Q9UGB7	285 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	RAB23	Q9ULC3	237 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	B9D1	Q9UPM9	204 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	APC2	O95996	2303 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	HELT	A6NFD8	242 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	ERICH4	A6NGS2	130 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	JAK2	O60674	1132 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	ANP32D	O95626	131 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	CHRNA1	P02708	482 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	GZMA	P12544	262 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
GTF2I-208	ENST00000482232	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms