RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-208ENST00000481518 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa20.38■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 IL32P24001 234 aa20.38■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 HOXC12P31275 282 aa20.38■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 H3F3AP84243 136 aa20.38■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 ITGADQ13349 1161 aa20.38■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 PDK3Q15120 406 aa20.38■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 TAB1Q15750 504 aa20.38■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa20.38■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 GALNT5Q7Z7M9 940 aa20.38■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa20.38■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 MAGEB18Q96M61 343 aa20.38■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 VAPAQ9P0L0 249 aa20.38■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 TMEM181Q9P2C4 612 aa20.38■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 TRAPPC4Q9Y296 219 aa20.38■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa20.37■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 LYZL6O75951 148 aa20.37■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 UQCRBP14927 111 aa20.37■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 ATP4BP51164 291 aa20.37■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 FADDQ13158 208 aa20.37■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 AGKQ53H12 422 aa20.37■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 DDIT4LQ96D03 193 aa20.37■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 TMEM204Q9BSN7 226 aa20.37■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 SPATA9Q9BWV2 254 aa20.37■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 IKZF5Q9H5V7 419 aa20.37■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 BCL2L10Q9HD36 194 aa20.37■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 EMC3Q9P0I2 261 aa20.37■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 TMEM247A6NEH6 219 aa20.36■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 IGHV3-9P01782 118 aa20.36■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 FPR1P21462 350 aa20.36■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 IGHV1-2P23083 117 aa20.36■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 SLC16A1P53985 500 aa20.36■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 SQLEQ14534 574 aa20.36■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 SERPINA11Q86U17 422 aa20.36■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 ZNF100Q8IYN0 542 aa20.36■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 CADM2Q8N3J6 435 aa20.36■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 PIGXQ8TBF5 258 aa20.36■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 RAD21L1Q9H4I0 556 aa20.36■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 DLL4Q9NR61 685 aa20.36■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 FRS3O43559 492 aa20.35■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 PGM3O95394 542 aa20.35■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 COX5AP20674 150 aa20.35■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 NR1H2P55055 460 aa20.35■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa20.35■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa20.35■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 CCL19Q99731 98 aa20.35■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 PIP5K1AQ99755 562 aa20.35■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 POTEKPQ9BYX7 375 aa20.35■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 ZNF385DQ9H6B1 395 aa20.35■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 ZNF232Q9UNY5 417 aa20.35■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 ARAFP10398 606 aa20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 MAP2K6P52564 334 aa20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 SLC35A1P78382 337 aa20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 HOXC5Q00444 222 aa20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 BNIP2Q12982 314 aa20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 ZNF311Q5JNZ3 666 aa20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 WBP2NLQ6ICG8 309 aa20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 C20orf204Q6ZNR8 217 aa20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 COMTD1Q86VU5 262 aa20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 NFKBIDQ8NI38 313 aa20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 BBS10Q8TAM1 723 aa20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 IGFBPL1Q8WX77 278 aa20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 STON2Q8WXE9 905 aa20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 PIGTQ969N2 578 aa20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 TMEM45AQ9NWC5 275 aa20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 DCTN4Q9UJW0 460 aa20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 IFT52Q9Y366 437 aa20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 GMEB1Q9Y692 573 aa20.34■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 A0A1W2PP18 115 aa20.33■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 EDF1O60869 148 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 CXCR1P25024 350 aa20.33■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 ZSWIM7Q19AV6 140 aa20.33■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 GCNT6Q5T4J0 391 aa20.33■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 FBXW9Q5XUX1 488 aa20.33■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 HSD17B8Q92506 261 aa20.33■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 APH1AQ96BI3 265 aa20.33■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 NPHS2Q9NP85 383 aa20.33■□□□□ 0.85
PSME4-208ENST00000481518 LIPT2A6NK58 231 aa20.32■□□□□ 0.84
PSME4-208ENST00000481518 C5orf58C9J3I9 102 aa20.32■□□□□ 0.84
PSME4-208ENST00000481518 GPR171O14626 319 aa20.32■□□□□ 0.84
PSME4-208ENST00000481518 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PSME4-208ENST00000481518 SMPD2O60906 423 aa20.32■□□□□ 0.84
PSME4-208ENST00000481518 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PSME4-208ENST00000481518 IDUAP35475 653 aa20.32■□□□□ 0.84
PSME4-208ENST00000481518 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PSME4-208ENST00000481518 COPZ1P61923 177 aa20.32■□□□□ 0.84
PSME4-208ENST00000481518 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PSME4-208ENST00000481518 CEACAM7Q14002 265 aa20.32■□□□□ 0.84
PSME4-208ENST00000481518 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms