RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 SNNO75324 88 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 CD8AP01732 235 aa18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 IL12AP29459 219 aa18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 CDKN1AP38936 164 aa18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 SLC1A3P43003 542 aa18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM108Q6UXF1 575 aa18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 WDR60Q8WVS4 1066 aa18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 OR52E6Q96RD3 313 aa18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 CENPHQ9H3R5 247 aa18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 THAP1Q9NVV9 213 aa18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 OSGIN1Q9UJX0 560 aa18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 TMED7Q9Y3B3 224 aa18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A15Q9Y619 301 aa18.49■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 TRPC5OSA6NMA1 111 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 PDLIM1O00151 329 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 AP3D1O14617 1153 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 RAD51DO75771 328 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV4-39P01824 125 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 DBIP07108 87 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 UQCRBP14927 111 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 PTAFRP25105 342 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 NTF4P34130 210 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 CDKN2CP42773 168 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 CDH11P55287 796 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35A1P78382 337 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 OR7E24Q6IFN5 339 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 HMGN2P46Q86SG4 172 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2J2Q8N2K1 259 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 MUS81Q96NY9 551 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB18Q99592 522 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 INPP5KQ9BT40 448 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 DSPPQ9NZW4 1301 aa18.48■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 CIB4A0PJX0 185 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 CFAP73A6NFT4 308 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 SLCO1B7G3V0H7 640 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 KRT75O95678 551 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3-9P01782 118 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 IMPDH2P12268 514 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 IL7RP16871 459 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 NME5P56597 212 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 OR2B6P58173 313 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 EPS8Q12929 822 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 NRF1Q16656 503 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 GSTA3Q16772 222 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 HHATQ5VTY9 493 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 AGAP6Q5VW22 663 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 PAQR6Q6TCH4 344 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL17Q6TDP4 642 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF621Q6ZSS3 439 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC103Q8IW40 242 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF440Q8IYI8 595 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 C17orf78Q8N4C9 275 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 REG4Q9BYZ8 158 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 ADAM19Q9H013 955 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 PARPBPQ9NWS1 579 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 DCTN4Q9UJW0 460 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa18.47■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM72A0PK05 275 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 RNF223E7ERA6 249 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 IL6P05231 212 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 ITGA5P08648 1049 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 NR2F1P10589 423 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 IDO1P14902 403 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 EPHA3P29320 983 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 TACR3P29371 465 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 ACVR1BP36896 505 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 SLC18A1P54219 525 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 WDR4P57081 412 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 DMTNQ08495 405 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 FAPQ12884 760 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 SLC17A1Q14916 467 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 GABRA6Q16445 453 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 COX20Q5RI15 118 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 PEX5LQ8IYB4 626 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM45BQ96B21 275 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 PIF1Q9H611 641 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 CALML5Q9NZT1 146 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 P2RX2Q9UBL9 471 aa18.46■□□□□ 0.55
LIMS1-208ENST00000428064 CSPG4Q6UVK1 2322 aa18.45■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 CADP27708 2225 aa18.45■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 CDHR4A6H8M9 788 aa18.45■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 CCT8L1PA6NM43 557 aa18.45■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 RFXANKO14593 260 aa18.45■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
LIMS1-208ENST00000428064 ZCCHC18P0CG32 403 aa18.45■□□□□ 0.54
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