RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 ZBTB18Q99592 522 aa18.37■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 OSGIN1Q9UJX0 560 aa18.37■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 PRDM4Q9UKN5 801 aa18.37■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 DSPPQ9NZW4 1301 aa18.37■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 JMJD1CQ15652 2540 aa18.37■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa18.36■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 A0A1W2PP18 115 aa18.36■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 SLCO1B7G3V0H7 640 aa18.36■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 RAMP1O60894 148 aa18.36■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 KRT75O95678 551 aa18.36■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 DBIP07108 87 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 IDO1P14902 403 aa18.36■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 SLC1A3P43003 542 aa18.36■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 TNK1Q13470 666 aa18.36■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 GNA13Q14344 377 aa18.36■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 MAPK11Q15759 364 aa18.36■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF621Q6ZSS3 439 aa18.36■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 TAS2R16Q9NYV7 291 aa18.36■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 TMED7Q9Y3B3 224 aa18.36■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM72A0PK05 275 aa18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 CFAP73A6NFT4 308 aa18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 PDLIM1O00151 329 aa18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 IGHV3-9P01782 118 aa18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 IL6P05231 212 aa18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 GSNP06396 782 aa18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 IL7RP16871 459 aa18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 TACR3P29371 465 aa18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP1-1Q07627 177 aa18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 EPS8Q12929 822 aa18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 CLEC12BQ2HXU8 276 aa18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 DNM1P46Q6ZS02 220 aa18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC103Q8IW40 242 aa18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 DDIT4LQ96D03 193 aa18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 RADILQ96JH8 1075 aa18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 SLC6A13Q9NSD5 602 aa18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 ASB6Q9NWX5 421 aa18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 SLC25A15Q9Y619 301 aa18.35■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 RFXANKO14593 260 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 ABCD4O14678 606 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 RAD51DO75771 328 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 CD8AP01732 235 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 ZCCHC18P0CG32 403 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 NR2F1P10589 423 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 IMPDH2P12268 514 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 UQCRBP14927 111 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 IDUAP35475 653 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 CDKN1AP38936 164 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 CDH11P55287 796 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 OR2B6P58173 313 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 SLC35A1P78382 337 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 ATG16L1Q676U5 607 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF440Q8IYI8 595 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 UBE2J2Q8N2K1 259 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 ZBTB9Q96C00 473 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 DNAJA3Q96EY1 480 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 MUS81Q96NY9 551 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 ADAM19Q9H013 955 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 FAIMQ9NVQ4 179 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 ZIM2Q9NZV7 527 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 P2RX2Q9UBL9 471 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa18.34■□□□□ 0.53
UBXN4-204ENST00000426921 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 CDHR4A6H8M9 788 aa18.33■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 INAFM1C9JVW0 142 aa18.33■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 SLC22A3O75751 556 aa18.33■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 ITGA5P08648 1049 aa18.33■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 CCNA2P20248 432 aa18.33■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 PCSK6P29122 969 aa18.33■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 VEZF1Q14119 521 aa18.33■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 SLC17A1Q14916 467 aa18.33■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 GSTA3Q16772 222 aa18.33■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 OR7E24Q6IFN5 339 aa18.33■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 PAQR6Q6TCH4 344 aa18.33■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM108Q6UXF1 575 aa18.33■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 PRIMA1Q86XR5 153 aa18.33■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 PEX5LQ8IYB4 626 aa18.33■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa18.33■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 MGAT4BQ9UQ53 548 aa18.33■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 CIB4A0PJX0 185 aa18.32■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 IGHV4-39P01824 125 aa18.32■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 KITP10721 976 aa18.32■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 PTAFRP25105 342 aa18.32■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 FAPQ12884 760 aa18.32■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 GABRA6Q16445 453 aa18.32■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa18.32■□□□□ 0.52
UBXN4-204ENST00000426921 LIN52Q52LA3 116 aa18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms