RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 ITGA10O75578 1167 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 SOX14O95416 240 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 MT-ATP6P00846 226 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 SAGP10523 405 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 APEHP13798 732 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 MAKP20794 623 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 CXCR1P25024 350 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 ADH6P28332 368 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 FMO3P31513 532 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 SLC6A6P31641 620 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 OTX2P32243 289 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 DLSTP36957 453 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 GPR4P46093 362 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 CCR4P51679 360 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 FBXW4P57775 412 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 MFSD13AQ14CX5 517 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 SNAPC1Q16533 368 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 PGGHGQ32M88 737 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 ARMC4Q5T2S8 1044 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 FAM69BQ5VUD6 431 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM236Q5W0B7 351 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 ACSM5Q6NUN0 579 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 KCTD8Q6ZWB6 473 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 DTX1Q86Y01 620 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 SPARTQ8N0X7 666 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 GATSQ8NAP1 163 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 PFN4Q8NHR9 129 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM163Q8TC26 289 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 FANK1Q8TC84 345 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 DUSP19Q8WTR2 217 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 ASB15Q8WXK1 588 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 FGF11Q92914 225 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 RFKQ969G6 155 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 SIGLEC11Q96RL6 698 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 DPH1Q9BZG8 443 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 UBQLN3Q9H347 655 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 EGLN3Q9H6Z9 239 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 METTL7AQ9H8H3 244 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF160Q9HCG1 818 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 P4HTMQ9NXG6 502 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 TAS2R10Q9NYW0 307 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF229Q9UJW7 825 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 SLC6A5Q9Y345 797 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.92□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 COL12A1Q99715 3063 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 MGAQ8IWI9 3026 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 A0A087WZY1 265 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 ENO4A6NNW6 628 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 A8MVM7 634 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 PTGES3LE9PB15 166 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 BHLHE40O14503 412 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 IMPA2O14732 288 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 ARPC3O15145 178 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 SURF4O15260 269 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 PRODHO43272 600 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF208O43345 1280 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 OIP5O43482 229 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 SCO2O43819 266 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 OR2T1O43869 369 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A12O75746 678 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFB2O95178 105 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 SNX4O95219 450 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 CDK1P06493 297 aa8.91□□□□□ -0.98
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POLR1A-202ENST00000409024 FUT1P19526 365 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 TACR3P29371 465 aa8.91□□□□□ -0.98
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POLR1A-202ENST00000409024 GABREP78334 506 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 CAMK2BQ13554 666 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 QPRTQ15274 297 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFAF6Q330K2 333 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 NADK2Q4G0N4 442 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 KLHL22Q53GT1 634 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 SLC22A10Q63ZE4 541 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 GPR141Q7Z602 305 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC103Q8IW40 242 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 OR8D4Q8NGM9 314 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-202ENST00000409024 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa8.91□□□□□ -0.98
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