RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 BBS1Q8NFJ9 593 aa20.85■□□□□ 0.93
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PTPRM-201ENST00000332175 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRM-201ENST00000332175 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa20.84■□□□□ 0.93
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PTPRM-201ENST00000332175 OR7A17O14581 309 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRM-201ENST00000332175 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRM-201ENST00000332175 OR4N4Q8N0Y3 316 aa20.84■□□□□ 0.93
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PTPRM-201ENST00000332175 T-ENOLP0DO92 83 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRM-201ENST00000332175 VEGFCP49767 419 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRM-201ENST00000332175 OR1D5P58170 312 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRM-201ENST00000332175 TNK1Q13470 666 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRM-201ENST00000332175 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PTPRM-201ENST00000332175 SLX4IPQ5VYV7 408 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRM-201ENST00000332175 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PTPRM-201ENST00000332175 GIMAP5Q96F15 307 aa20.82■□□□□ 0.92
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