RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262435.13

SMURF2-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2-201ENST00000262435 GARNL3Q5VVW2 1013 aa14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 PARGQ86W56 976 aa14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 OR51Q1Q8NH59 317 aa14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 GHITMQ9H3K2 345 aa14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 KLK11Q9UBX7 282 aa14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 TEX46H3BTG2 121 aa14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 CRYZL1O95825 349 aa14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 IGKV1D-16P01601 117 aa14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 EPXP11678 715 aa14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 ERVK-25P63136 954 aa14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 DNAAF1Q8NEP3 725 aa14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 STMN3Q9NZ72 180 aa14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 RCE1Q9Y256 329 aa14.51□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 HK1P19367 917 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 ZNF511Q8NB15 262 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 SPACA7Q96KW9 195 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 SERINC2Q96SA4 455 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 SEMA4CQ9C0C4 833 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 FOLH1BQ9HBA9 442 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 NOX4Q9NPH5 578 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 ACTR10Q9NZ32 417 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 HCN3Q9P1Z3 774 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 BRWD1Q9NSI6 2320 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 FLRT2O43155 660 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 GATBO75879 557 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 ADH1BP00325 375 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 C1orf61Q13536 156 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 KCNAB1Q14722 419 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 RNF44Q7L0R7 432 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 FAM109AQ8N4B1 249 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 C10orf53Q8N6V4 93 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 CEP76Q8TAP6 659 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 FOXN4Q96NZ1 517 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 LMF1Q96S06 567 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 PHF11Q9UIL8 331 aa14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 TRABD2BA6NFA1 517 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 LEUTXA8MZ59 168 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 H7C1C5 153 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 K7EQS6 105 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 SELENOPP49908 381 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 CCR4P51679 360 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 LCN6P62502 163 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 RPS15P62841 145 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 POMZP3Q6PJE2 187 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 USP53Q70EK8 1073 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 LINC01565O15544 149 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 PTP4A3O75365 173 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 H2AFB2P0C5Z0 115 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 ZNF250P15622 560 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 RIN1Q13671 783 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 SMUG1Q53HV7 270 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 FHL5Q5TD97 284 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 RTL4Q6ZR62 310 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 FCRLAQ7L513 359 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 CDRT4Q8N9R6 151 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 SUN5Q8TC36 379 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 NR4A3Q92570 626 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 HSPA12BQ96MM6 686 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 GAL3ST1Q99999 423 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 KLF15Q9UIH9 416 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 PILRAQ9UKJ1 303 aa14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 GDNFP39905 211 aa14.48□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 VEGFCP49767 419 aa14.48□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 NRG3P56975 720 aa14.48□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 ARPC4P59998 168 aa14.48□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 SIRPAP78324 504 aa14.48□□□□□ -0.09
SMURF2-201ENST00000262435 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms