RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm13078A2AGW8 474 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm266A6H634 200 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spata6lB2RV46 347 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 B3galt2O54905 422 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nr4a1P12813 601 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gja4P28235 333 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fgf13P70377 245 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bcl2a1bQ497M6 172 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Acvr1bQ61271 505 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 D11Wsu47eQ6PIX9 558 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tas2r135Q7TQA9 312 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mrps7Q80X85 242 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mettl7a1Q8C6B0 244 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GatcQ8CBY0 155 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpr18Q8K1Z6 331 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1261Q8VFB0 306 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smarcd2Q99JR8 531 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Steap1Q9CWR7 339 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stk25Q9Z2W1 426 aa15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cacna1eQ61290 2272 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igf2rQ07113 2483 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 1700025B11RikA0A087WNZ6 93 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrrc72A0A1Y7VMI0 288 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GlsD3Z7P3 674 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r110E9PWD5 858 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r113E9PZA6 856 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aldh3b3J3QMK6 479 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hoxb6P09023 224 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 FahP35505 419 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tead3P70210 439 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mat2aQ3THS6 395 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 March9Q3TZ87 348 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Garem1Q3UFT3 876 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MertkQ60805 994 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ManeaQ6NXH2 462 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eid2Q6X7S9 236 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MdficQ8BX65 247 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cep68Q8C0D9 733 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rhbdl1Q8VC82 373 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1043Q8VFK4 314 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 D6Wsu163eQ91YN0 552 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rwdd2bQ99M03 290 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lbx2Q9WUN8 195 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lama2Q60675 3118 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ajap1A2ALI5 412 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AgmatA2AS89 358 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam84bD3YXJ5 310 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3327F7C9A1 213 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prdx6O08709 224 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cacng2O88602 323 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nup43P59235 380 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rps7P62082 194 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Entpd6Q3U0P5 455 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vdac3Q60931 283 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cd47Q61735 303 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 IppkQ6P1C1 489 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc6a7Q6PGE7 637 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nup107Q8BH74 926 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ap5m1Q8BJ63 490 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm11541Q8C4D8 108 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kremen2Q8K1S7 461 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Etv3Q8R4Z4 513 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1312Q8VF10 317 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gatad2bQ8VHR5 594 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r85Q8VIB8 308 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Clec2dQ91V08 207 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sucnr1Q99MT6 317 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tspan31Q9CQ88 210 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lypd6bQ9D7F2 191 aa15.81■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rasgef1aA0A0N4SVR5 498 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AurkcO88445 282 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Creg1O88668 220 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 H2-Q7P14429 334 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 H2-Q9P14431 200 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nckap1P28660 1128 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btg1P62325 171 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc30a1Q60738 503 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DgkzQ80UP3 929 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q8BHB7 409 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hpf1Q8CFE2 346 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc43a2Q8CGA3 568 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc16a14Q8K1C7 512 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rab38Q8QZZ8 211 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hbp1Q8R316 516 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr98Q8VFD9 309 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tnk1Q99ML2 666 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NtmQ99PJ0 344 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cmss1Q9CZT6 276 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sertad3Q9ERC3 197 aa15.8■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Crmp1P97427 572 aa15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ankrd53Q3V0J4 497 aa15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Clcn4Q61418 747 aa15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nptx1Q62443 432 aa15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 B130006D01RikQ8BRH6 153 aa15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1491Q8VEZ5 319 aa15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trappc2Q9CQP2 140 aa15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 4933436I01RikQ9D3T1 429 aa15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Jam3Q9D8B7 310 aa15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Isyna1Q9JHU9 557 aa15.79■□□□□ 0.12
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spag17Q5S003 2320 aa15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55.2 ms