RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 CCT8L1PA6NM43 557 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD28O15084 1053 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 PMS2P2O95744 297 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 AGR2O95994 175 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 BPGMP07738 259 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 CD40P25942 277 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF83P51522 516 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 NUDT6P53370 316 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 SLC16A1P53985 500 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 CASP9P55211 416 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 DSCR9P59020 149 aa21.93■■□□□ 1.1
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PTPRF-216ENST00000617451 SMU1Q2TAY7 513 aa21.93■■□□□ 1.1
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PTPRF-216ENST00000617451 SLC22A25Q6T423 547 aa21.93■■□□□ 1.1
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PTPRF-216ENST00000617451 OR8J2Q8NGG1 315 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF563Q8TA94 476 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 XAGE5Q8WWM1 108 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 SAP130Q9H0E3 1048 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 POLE3Q9NRF9 147 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 ASB6Q9NWX5 421 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 MALT1Q9UDY8 824 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 WDR45Q9Y484 360 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 FAM234BA2RU67 622 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 GPR171O14626 319 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 DNPH1O43598 174 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 NUDT17P0C025 328 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 DHRS4L1P0CG22 281 aa21.92■■□□□ 1.1
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PTPRF-216ENST00000617451 ATAD3BQ5T9A4 648 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 GRINAQ7Z429 371 aa21.92■■□□□ 1.1
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PTPRF-216ENST00000617451 OR4A15Q8NGL6 344 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 PIGXQ8TBF5 258 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 ZG16BQ96DA0 208 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 MUS81Q96NY9 551 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 TAS2R16Q9NYV7 291 aa21.92■■□□□ 1.1
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PTPRF-216ENST00000617451 PCDHGB4Q9UN71 923 aa21.92■■□□□ 1.1
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PTPRF-216ENST00000617451 C6orf52Q5T4I8 152 aa21.91■■□□□ 1.1
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PTPRF-216ENST00000617451 EMBQ6PCB8 327 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 CLEC2AQ6UVW9 174 aa21.91■■□□□ 1.1
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PTPRF-216ENST00000617451 ADGRG3Q86Y34 549 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC103Q8IW40 242 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 FBXL14Q8N1E6 418 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 RAB8BQ92930 207 aa21.91■■□□□ 1.1
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PTPRF-216ENST00000617451 OR11A1Q9GZK7 315 aa21.91■■□□□ 1.1
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PTPRF-216ENST00000617451 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 H3F3AP84243 136 aa21.9■■□□□ 1.1
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PTPRF-216ENST00000617451 FUT5Q11128 374 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 RAB35Q15286 201 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM249Q2WGJ8 235 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 ELOA3BQ3SY89 546 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 OR7E24Q6IFN5 339 aa21.9■■□□□ 1.1
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PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD46Q86W74 232 aa21.9■■□□□ 1.1
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PTPRF-216ENST00000617451 ELOA3Q8NG57 546 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRF-216ENST00000617451 AKTIPQ9H8T0 292 aa21.9■■□□□ 1.1
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PTPRF-216ENST00000617451 FABP6P51161 128 aa21.89■■□□□ 1.09
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PTPRF-216ENST00000617451 SAXO2Q658L1 398 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-216ENST00000617451 DEPDC4Q8N2C3 294 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-216ENST00000617451 HTRA1Q92743 480 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRF-216ENST00000617451 CLDN24A6NM45 220 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-216ENST00000617451 H7C417 338 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-216ENST00000617451 M0R1B8 84 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-216ENST00000617451 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEA8P43361 318 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRF-216ENST00000617451 OR2B6P58173 313 aa21.88■■□□□ 1.09
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