RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 UPK1BO75841 260 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNK2O95069 426 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 GABRA4P48169 554 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 CDH11P55287 796 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF141Q15928 474 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 CCNJQ5T5M9 372 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 SIMC1Q8NDZ2 872 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 OR52L1Q8NGH7 329 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 PIK3R3Q92569 461 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 MED18Q9BUE0 208 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 ULBP3Q9BZM4 244 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 SP140LQ9H930 580 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 FOLH1BQ9HBA9 442 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNE5Q9UJ90 142 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 FITM1A5D6W6 292 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 H0YIG0 161 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 IL1AP01583 271 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHA1P01876 353 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 F8A1P23610 371 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 HTR2AP28223 471 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 HSD17B7P56937 341 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF550Q7Z398 422 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 LAPTM4BQ86VI4 370 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 OR52N1Q8NH53 320 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 G6PC3Q9BUM1 346 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 ASPNQ9BXN1 380 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A18Q9H1K4 315 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 TLCD2A6NGC4 264 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 TERTO14746 1132 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
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CAPNS1-204ENST00000587718 CHP2O43745 196 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 PRAMEF2O60811 474 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 GALP22466 123 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 ETV1P50549 477 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 BCAP31P51572 246 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP1A4Q13733 1029 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 SERTAD2Q14140 314 aa23.35■■□□□ 1.33
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CAPNS1-204ENST00000587718 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 BTLAQ7Z6A9 289 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 LSMEM1Q8N8F7 131 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 RIT1Q92963 219 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 VSTM2LQ96N03 204 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 NUAK2Q9H093 628 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 MED31Q9Y3C7 131 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 FUOMA2VDF0 154 aa23.34■■□□□ 1.33
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CAPNS1-204ENST00000587718 GPR4P46093 362 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 CAPZA2P47755 286 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 EMDP50402 254 aa23.34■■□□□ 1.33
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CAPNS1-204ENST00000587718 FLYWCH1Q4VC44 716 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 LNX2Q8N448 690 aa23.34■■□□□ 1.33
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CAPNS1-204ENST00000587718 WDFY2Q96P53 400 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM117AQ9C073 453 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 UBQLN3Q9H347 655 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 NTNG1Q9Y2I2 539 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa23.33■■□□□ 1.33
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CAPNS1-204ENST00000587718 TSPAN19P0C672 248 aa23.33■■□□□ 1.33
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CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC190Q86UF4 302 aa23.33■■□□□ 1.33
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CAPNS1-204ENST00000587718 RNF31Q96EP0 1072 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 DGAT2Q96PD7 388 aa23.33■■□□□ 1.33
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CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC32Q9BV29 185 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 INPP5EQ9NRR6 644 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 TUBD1Q9UJT1 453 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAPPC4Q9Y296 219 aa23.33■■□□□ 1.33
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CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0B4J2E0 115 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1B0GX12 115 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 GXYLT2A0PJZ3 443 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35F4A4IF30 521 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 NPIPB9F8W1W9 429 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 PEX12O00623 359 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 HCRTR1O43613 425 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 FOLR1P15328 257 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 GCGRP47871 477 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 FUT7Q11130 342 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC30A6Q6NXT4 461 aa23.32■■□□□ 1.32
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