RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587215.1

PKN1-209, Transcript of protein kinase N1, humanhuman

TSL 3

Gene PKN1, Length 363 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1-209ENST00000587215 GRINAQ7Z429 371 aa14.66□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 CROCCP2Q86T23 111 aa14.66□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 DNAJA3Q96EY1 480 aa14.66□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 OR52E6Q96RD3 313 aa14.66□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 PANX1Q96RD7 426 aa14.66□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 CXorf56Q9H5V9 222 aa14.66□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 NGBQ9NPG2 151 aa14.66□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 THAP1Q9NVV9 213 aa14.66□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 CHRNA9Q9UGM1 479 aa14.66□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 LIPT1Q9Y234 373 aa14.66□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 TMEM120BA0PK00 339 aa14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 AGAP5A6NIR3 686 aa14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 OVOL3O00110 214 aa14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 AP3D1O14617 1153 aa14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 HDAC3O15379 428 aa14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 CLOCKO15516 846 aa14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 PMS2P2O95744 297 aa14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 CD3EP07766 207 aa14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 CHRM4P08173 479 aa14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 SOD3P08294 240 aa14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 BSPH1Q075Z2 132 aa14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 MAPK11Q15759 364 aa14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 COX20Q5RI15 118 aa14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 POTEKPQ9BYX7 375 aa14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 OR11A1Q9GZK7 315 aa14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PKN1-209ENST00000587215 RAMP1O60894 148 aa14.64□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 KITP10721 976 aa14.64□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 CCNA2P20248 432 aa14.64□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 COX5AP20674 150 aa14.64□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 ATP5J2P56134 94 aa14.64□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 H3F3AP84243 136 aa14.64□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 CCDC103Q8IW40 242 aa14.64□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 TRIML2Q8N7C3 387 aa14.64□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 SLC6A13Q9NSD5 602 aa14.64□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.64□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa14.64□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 TRPC5OSA6NMA1 111 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 IGHV3-9P01782 118 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 GGT1P19440 569 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 MVDP53602 400 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 SLC18A1P54219 525 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 HPCAP84074 193 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 LRRC74AQ0VAA2 488 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 PPA1Q15181 289 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 STK11Q15831 433 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 PGGHGQ32M88 737 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 CMIPQ8IY22 773 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 KBTBD8Q8NFY9 601 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 MGARPQ8TDB4 240 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 FBXW5Q969U6 566 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 TRIM2Q9C040 744 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 EMC3Q9P0I2 261 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 OSGIN1Q9UJX0 560 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 TMED7Q9Y3B3 224 aa14.63□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 TMEM72A0PK05 275 aa14.62□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 DNPH1O43598 174 aa14.62□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 SLC22A3O75751 556 aa14.62□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 NR2F1P10589 423 aa14.62□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 IMPDH2P12268 514 aa14.62□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 IL7RP16871 459 aa14.62□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 TACR3P29371 465 aa14.62□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 SLC1A3P43003 542 aa14.62□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 HTR3AP46098 478 aa14.62□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 SLC16A1P53985 500 aa14.62□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 OR2B6P58173 313 aa14.62□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.62□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 MAVSQ7Z434 540 aa14.62□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 P2RY8Q86VZ1 359 aa14.62□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 WDR60Q8WVS4 1066 aa14.62□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 PMM1Q92871 262 aa14.62□□□□□ -0.07
PKN1-209ENST00000587215 MUCL1Q96DR8 90 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms