RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	ENTPD6	O75354	484 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	STX11	O75558	287 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RCBTB2	O95199	551 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	IL33	O95760	270 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TNF	P01375	233 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HLA-DPB1	P04440	258 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CA3	P07451	260 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TSPAN19	P0C672	248 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HSMCR30	P0CW71	290 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CKMT1A	P12532	417 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	F3	P13726	295 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	POU2F1	P14859	743 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TNNI3	P19429	210 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CPN2	P22792	545 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	FCAR	P24071	287 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GADD45A	P24522	165 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	FPR3	P25089	353 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	AKT2	P31751	481 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MTNR1A	P48039	350 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GSS	P48637	474 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	BLK	P51451	505 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LIMK1	P53667	647 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PRKAG1	P54619	331 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LIM2	P55344	173 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	WNT4	P56705	351 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SOX8	P57073	446 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NCS1	P62166	190 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CYP4F2	P78329	520 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	EFNB1	P98172	346 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	BDH1	Q02338	343 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SCN1B	Q07699	218 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ACSM1	Q08AH1	577 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TPBG	Q13641	420 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GINS1	Q14691	196 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NFATC4	Q14934	902 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	KIR2DS5	Q14953	304 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PLK5	Q496M5	336 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	PAQR7	Q86WK9	346 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OOSP2	Q86WS3	158 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GID4	Q8IVV7	300 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SGCD	Q92629	289 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB8B	Q92930	207 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	KCTD7	Q96MP8	289 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	LRFN5	Q96NI6	719 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-215	ENST00000583289	OR7D2	Q96RA2	312 aa		4.18	□□□□□ -1.74

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