RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 PKP2Q99959 881 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 PIGQQ9BRB3 760 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 ADAM19Q9H013 955 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 C12orf10Q9HB07 376 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
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PRPF8-210ENST00000574217 U3KQV3 271 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
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PRPF8-210ENST00000574217 H3BML4 177 aa6.05□□□□□ -1.44
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PRPF8-210ENST00000574217 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 A0A087WUU8 490 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM72A0PK05 275 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 GJE1A6NN92 205 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 A8MVM7 634 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 G3V2T6 193 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 ZNHIT1O43257 154 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF208O43345 1280 aa6.04□□□□□ -1.44
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