RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-229	ENST00000551936	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	OR52E6	Q96RD3	313 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	NGB	Q9NPG2	151 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	LIPT1	Q9Y234	373 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	ROS1	P08922	2347 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	AGAP5	A6NIR3	686 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	ZNF716	A6NP11	495 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	AP3D1	O14617	1153 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	PGM3	O95394	542 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	CD3E	P07766	207 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	DANCR	P0C864	163 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	KIT	P10721	976 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	NTF4	P34130	210 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	SLC18A1	P54219	525 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	HPCA	P84074	193 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	MAPK11	Q15759	364 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	COX20	Q5RI15	118 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	CMIP	Q8IY22	773 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	MGARP	Q8TDB4	240 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	NEUROG1	Q92886	237 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	OVOL3	O00110	214 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	CLOCK	O15516	846 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	CCNA2	P20248	432 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	COX5A	P20674	150 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	MVD	P53602	400 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	ATG16L1	Q676U5	607 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	CCDC103	Q8IW40	242 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	PMM1	Q92871	262 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	FBXW5	Q969U6	566 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	ZBTB18	Q99592	522 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	TMEM72	A0PK05	275 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	FAAH	O00519	579 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	RFXANK	O14593	260 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	ZNF208	O43345	1280 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	DNPH1	O43598	174 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	RAMP1	O60894	148 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	IL6	P05231	212 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	SOD3	P08294	240 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	NR2F1	P10589	423 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	IMPDH2	P12268	514 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	IL7R	P16871	459 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	HTR3A	P46098	478 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	SLC16A1	P53985	500 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	H3F3A	P84243	136 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	BSPH1	Q075Z2	132 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	EPS8	Q12929	822 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	PPA1	Q15181	289 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	STK11	Q15831	433 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	NXN	Q6DKJ4	435 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	PIGX	Q8TBF5	258 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	TLCD1	Q96CP7	247 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	TRIM2	Q9C040	744 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	ADAM19	Q9H013	955 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CS-229	ENST00000551936	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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