RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 RNF180Q86T96 592 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 CFAP206Q8IYR0 622 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 MMP21Q8N119 569 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 OR6N1Q8NGY5 312 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 PIGKQ92643 395 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 THRSPQ92748 146 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 WBP2Q969T9 261 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 MIB2Q96AX9 1013 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ARL5BQ96KC2 179 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 COMMD9Q9P000 198 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM74A7A6NL05 159 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM183AA6NL82 134 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 E9PI62 339 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 GOSR2O14653 212 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 SEPT4O43236 478 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 BCL2L11O43521 198 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 BNIP3LO60238 219 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 GREM1O60565 184 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 FMO6PO60774 539 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 S100A6P06703 90 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 HEXAP06865 529 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 THBS1P07996 1170 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC25A4P12235 298 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF35P13682 527 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 DPP4P27487 766 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 TEAD1P28347 426 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 PDHA2P29803 388 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 CD70P32970 193 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 OR1D2P34982 312 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 SSR2P43308 183 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC11A1P49279 550 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 P2RX1P51575 399 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 PRKAG1P54619 331 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 OR12D2P58182 307 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 FUT5Q11128 374 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 CRHR2Q13324 411 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 FGL2Q14314 439 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 GRM7Q14831 915 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 CCL14Q16627 93 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 AVPI1Q5T686 147 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF613Q6PF04 617 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF546Q86UE3 836 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 C17orf47Q8NEP4 570 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 OR4D9Q8NGE8 314 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 OR7D2Q96RA2 312 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 F2RL3Q96RI0 385 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 SPG21Q9NZD8 308 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 GPR34Q9UPC5 381 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 YIPF1Q9Y548 306 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa6.96□□□□□ -1.29
HMBOX1-211ENST00000524238 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 A0A0A6YYD5 115 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM218A2RU14 115 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ANTXRLA6NF34 631 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms