RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAPK14Q16539 360 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 TBRG1Q3YBR2 411 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 KLHL26Q53HC5 615 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CRB2Q5IJ48 1285 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF311Q5JNZ3 666 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC22A10Q63ZE4 541 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ERICH5Q6P6B1 374 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 OPN5Q6U736 354 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 APOOLQ6UXV4 268 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC80Q76M96 950 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 MDGA2Q7Z553 956 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 DHFR2Q86XF0 187 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 VRK2Q86Y07 508 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC34A3Q8N130 599 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR8H3Q8N146 312 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 LILRA2Q8N149 483 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 BEST3Q8N1M1 668 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF619Q8N2I2 560 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CLIP4Q8N3C7 705 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 SVOPQ8N4V2 548 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 METTL25Q8N6Q8 603 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 C17orf47Q8NEP4 570 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 TNIP2Q8NFZ5 429 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR52P1PQ8NH57 321 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC22A8Q8TCC7 542 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 DUSP19Q8WTR2 217 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ABHD5Q8WTS1 349 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 HAS2Q92819 552 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 HGDQ93099 445 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM162AQ96A26 154 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMCO6Q96DC7 493 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 COL21A1Q96P44 957 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 NODALQ96S42 347 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC38A1Q9H2H9 487 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 GORASP2Q9H8Y8 452 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 UBQLN4Q9NRR5 601 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 P2RX2Q9UBL9 471 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC7A8Q9UHI5 535 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC23A1Q9UHI7 598 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 POMPQ9Y244 141 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 WDR45Q9Y484 360 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGF2RP11717 2491 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 DMXL1Q9Y485 3027 aa4.88□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CACNA1AO00555 2505 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMEM8BA6NDV4 472 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 SERINC4A6NH21 518 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR6C70A6NIJ9 312 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 AGAP5A6NIR3 686 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CLDN24A6NM45 220 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 G3V3Y1 287 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 TP53I11O14683 189 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ARPC2O15144 300 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 SUV39H1O43463 412 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 HS6ST1O60243 411 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 PSPNO60542 156 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ICOSLGO75144 302 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CIB2O75838 187 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CEACAM4O75871 244 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CYP7B1O75881 506 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 STAMBPO95630 424 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF682O95780 498 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 AK1P00568 194 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 SERPINA1P01009 418 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 IFNA14P01570 189 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 OPN1SWP03999 348 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 DBIP07108 87 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 GUSBP08236 651 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ETS2P15036 469 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 HPGDP15428 266 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 IL7RP16871 459 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CNR1P21554 472 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 IL12BP29460 328 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 PCGF2P35227 344 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CASP3P42574 277 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 KIR2DL3P43628 341 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CLK3P49761 638 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 UCNP55089 124 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 BPIFB3P59826 476 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 SELENOWP63302 87 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 MFAP5Q13361 173 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 TUBA3CQ13748 450 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR1C1Q15619 314 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF141Q15928 474 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 NTRK2Q16620 822 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 DUSP7Q16829 419 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 LINC00303Q3SY05 128 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 CYBRD1Q53TN4 286 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-205ENST00000519068 PDZK1Q5T2W1 519 aa4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms