RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 RIPK4P57078 832 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 DSCR10P59022 87 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC173Q0VFZ6 552 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 ARL6IP1Q15041 203 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL38Q2WGJ6 581 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 PDZK1Q5T2W1 519 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZR54 194 aa5.72□□□□□ -1.49
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PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R42Q7RTR8 314 aa5.72□□□□□ -1.49
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PTPRC-212ENST00000491302 SEC22AQ96IW7 307 aa5.72□□□□□ -1.49
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PTPRC-212ENST00000491302 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
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PTPRC-212ENST00000491302 EHD1Q9H4M9 534 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRC-212ENST00000491302 XKRY2A2RUG3 117 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-212ENST00000491302 ZBED8Q8IZ13 594 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 ST8SIA1Q92185 356 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRC-212ENST00000491302 TCEANC2Q96MN5 208 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRC-212ENST00000491302 MTMR9Q96QG7 549 aa5.68□□□□□ -1.5
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