RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488612.5

RAD51B-212, Transcript of RAD51 paralog B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD51B, Length 1,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF613Q6PF04 617 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 ULK3Q6PHR2 472 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 GRINAQ7Z429 371 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 OR4C15Q8NGM1 316 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 SLC7A13Q8TCU3 470 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 WBP1Q96G27 269 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 DOCK7Q96N67 2140 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF426Q9BUY5 554 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 FNDC11Q9BVV2 318 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 TMEM27Q9HBJ8 222 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 C20orf141Q9NUB4 165 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 B4GALT7Q9UBV7 327 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 NBASA2RRP1 2371 aa7.26□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 A0A087WUJ7 227 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 A0A087WUU8 490 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 A0A087WZY1 265 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 A0A1B0GTH9 108 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 A0A1W2PNR3 127 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 C7orf72A4D263 438 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 CLOCKO15516 846 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 GADD45GO95257 159 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 H1F0P07305 194 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 FUT1P19526 365 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 KLK2P20151 261 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 SFTPDP35247 375 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 LHX2P50458 406 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 CLDN20P56880 219 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 INAQ16352 499 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 GGNQ86UU5 652 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 UBQLNLQ8IYU4 475 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 OR2T29Q8NH02 315 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 NEIL3Q8TAT5 605 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 FAR1Q8WVX9 515 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 TMEM234Q8WY98 164 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 SMPDL3BQ92485 455 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 NR4A3Q92570 626 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 SFXN2Q96NB2 322 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 GPA33Q99795 319 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 PIGQQ9BRB3 760 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 PTDSS2Q9BVG9 487 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 EVA1AQ9H8M9 152 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 ACKR4Q9NPB9 350 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 QPCTLQ9NXS2 382 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 CHRNA9Q9UGM1 479 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 A0A0J9YW62 118 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 A0A1B0GVC2 190 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 A0A1W2PRQ8 180 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 TTLL8A6PVC2 850 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 SEC14L5O43304 696 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 NPIPB7O75200 414 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 SFTPCP11686 197 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 IMPDH2P12268 514 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 UQCRBP14927 111 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF17P17021 662 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 ITGA2P17301 1181 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 PRKACGP22612 351 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 CBLP22681 906 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 CXCR1P25024 350 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 ADH6P28332 368 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 CLDN18P56856 261 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 LTBQ06643 244 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 ST3GAL3Q11203 375 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 DGCR6Q14129 220 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 TRAM2Q15035 370 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 RCN1Q15293 331 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 ATP6AP1Q15904 470 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 ELOA3BQ3SY89 546 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 SYT14P1Q58G82 188 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 FGD3Q5JSP0 725 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 VASNQ6EMK4 673 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.25□□□□□ -1.25
RAD51B-212ENST00000488612 CYP4Z1Q86W10 505 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms