RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 APMAPQ9HDC9 416 aa3.65□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MED17Q9NVC6 651 aa3.65□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 RARRES3Q9UL19 164 aa3.65□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SRPK3Q9UPE1 567 aa3.65□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa3.65□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa3.65□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CORINQ9Y5Q5 1042 aa3.65□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNMB2Q9Y691 235 aa3.65□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa3.65□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TECTAO75443 2155 aa3.65□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PNR3 127 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM86C2PA6NEL3 165 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FRG2CA6NGY1 282 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 C17orf51A8MQB3 221 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 IDSB3KWA1 339 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 BHLHE40O14503 412 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ICOSLGO75144 302 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PTP4A3O75365 173 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GPX5O75715 221 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP1R3DO95685 299 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 HEXBP07686 556 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 UBL4AP11441 157 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ITPKBP27987 946 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GAS1P54826 345 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS7P62081 194 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TUBA1BP68363 451 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PLCXD2Q0VAA5 305 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 EBPQ15125 230 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GXYLT1Q4G148 440 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NXNL2Q5VZ03 156 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 RTL4Q6ZR62 310 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 USP43Q70EL4 1123 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TUBA1AQ71U36 451 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 COX15Q7KZN9 410 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 RABEPKQ7Z6M1 372 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 IGFN1Q86VF2 1251 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ATCAYQ86WG3 371 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 LNX2Q8N448 690 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PLPP5Q8NEB5 264 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4D9Q8NGE8 314 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OR51G2Q8NGK0 314 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MCFD2Q8NI22 146 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF563Q8TA94 476 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NAT6Q93015 286 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 BORCS5Q969J3 196 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM203Q969S6 136 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 C3orf49Q96BT1 292 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 HSPBAP1Q96EW2 488 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 DEPDC7Q96QD5 511 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CTRCQ99895 268 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TAPBPLQ9BX59 468 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 HOXD1Q9GZZ0 328 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NCOR1O75376 2440 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 HEATR5AQ86XA9 2040 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A087WUJ7 227 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 IRGMA1A4Y4 181 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CLDN25C9JDP6 229 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF264O43296 627 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRTM2O43300 516 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 HCRTR2O43614 444 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NUDT14O95848 222 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPAN19P0C672 248 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PAICSP22234 425 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 HTR1FP30939 366 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 UGT2B10P36537 528 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL4P36578 427 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CD79BP40259 229 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 RBM34P42696 430 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR143P51810 404 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 WNT4P56705 351 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ITGADQ13349 1161 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ELOA3BQ3SY89 546 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 C3orf38Q5JPI3 329 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 POMZP3Q6PJE2 187 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00114Q6XXX2 140 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MARCH3Q86UD3 253 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP1R3BQ86XI6 285 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CROCCP3Q8IVE0 287 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF440Q8IYI8 595 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GHDCQ8N2G8 530 aa3.64□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 C10orf53Q8N6V4 93 aa3.64□□□□□ -1.83
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