RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368147.8

SPTA1-201, Transcript of spectrin alpha, erythrocytic 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTA1, Length 7,999 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Dendrite .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1-201ENST00000368147 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.63□□□□□ -1.35
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SPTA1-201ENST00000368147 C7orf26Q96N11 449 aa6.63□□□□□ -1.35
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SPTA1-201ENST00000368147 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.62□□□□□ -1.35
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SPTA1-201ENST00000368147 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.62□□□□□ -1.35
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SPTA1-201ENST00000368147 NANOGQ9H9S0 305 aa6.62□□□□□ -1.35
SPTA1-201ENST00000368147 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.62□□□□□ -1.35
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