RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 DFFBO76075 338 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 STK17BO94768 372 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 EML2O95834 649 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 CCL4P13236 92 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 SYT1P21579 422 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 DCTP40126 519 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 ACTR1BP42025 376 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 SYKP43405 635 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 ATP5OP48047 213 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
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CCL20-201ENST00000358813 ZBTB17Q13105 803 aa4.82□□□□□ -1.64
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CCL20-201ENST00000358813 HMCESQ96FZ2 354 aa4.82□□□□□ -1.64
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CCL20-201ENST00000358813 PAGE5Q96GU1 130 aa4.82□□□□□ -1.64
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CCL20-201ENST00000358813 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 HACD3Q9P035 362 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 RNF14Q9UBS8 474 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CCL20-201ENST00000358813 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.8□□□□□ -1.64
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