RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 OR4N2Q8NGD1 307 aa18■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 OR6C4Q8NGE1 309 aa18■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 PGLYRP3Q96LB9 341 aa18■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 MARVELD1Q9BSK0 173 aa18■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ICAM5Q9UMF0 924 aa18■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 SCN2AQ99250 2005 aa18■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 DVL2O14641 736 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ORC5O43913 435 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ADAM11O75078 769 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 SLC43A1O75387 559 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 CLUP10909 449 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 GLULP15104 373 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 E2F1Q01094 437 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 CCINQ13939 588 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 FAM53BQ14153 422 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 RCBTB1Q8NDN9 531 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 OR52E2Q8NGJ4 325 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 TCTN2Q96GX1 697 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 A0A0B4J293 547 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 CD1AP06126 327 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ALAS2P22557 587 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 PYCR1P32322 319 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 THBS2P35442 1172 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 CDK10Q15131 360 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ACSM3Q53FZ2 586 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 KIRREL2Q6UWL6 708 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 NOXA1Q86UR1 476 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 PARGQ86W56 976 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 TCTE3Q8IZS6 198 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 OIT3Q8WWZ8 545 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 RNF31Q96EP0 1072 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 HCN3Q9P1Z3 774 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 RASD1Q9Y272 281 aa17.99■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 A0A087WUJ7 227 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 OGG1O15527 345 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF749O43361 778 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 NSA2O95478 260 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 PITPNBP48739 271 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 BIKQ13323 160 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ISXQ2M1V0 245 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 PEX11GQ96HA9 241 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 SLC19A3Q9BZV2 496 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 SERINC4A6NH21 518 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 HRO43593 1189 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 FOXS1O43638 330 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 CSTAP01040 98 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 GALNSP34059 522 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 GPR3P46089 330 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 SLC35D3Q5M8T2 416 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 NPSR1Q6W5P4 371 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 SAMD12Q8N8I0 201 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 C17orf47Q8NEP4 570 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 GHSRQ92847 366 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 RFT1Q96AA3 541 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 CREB3L1Q96BA8 519 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 KLHDC7BQ96G42 594 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 DMRTB1Q96MA1 342 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 MFRPQ9BY79 579 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 RBCK1Q9BYM8 510 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 HDHD2Q9H0R4 259 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 MARCH7Q9H992 704 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 NLKQ9UBE8 527 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 FBXL4Q9UKA2 621 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 OR10H1Q9Y4A9 318 aa17.98■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 A0A0G2JMP0 313 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 A0A0X1KG70 313 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 A8MV72 311 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 TGFBR3LH3BV60 316 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ARL6IP5O75915 188 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 GYPBP06028 91 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 RAB3BP20337 219 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 FUT7Q11130 342 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 C1orf61Q13536 156 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 PON3Q15166 354 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 BICRALQ6AI39 1079 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 PYHIN1Q6K0P9 492 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 OR4M2Q8NGB6 313 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 OR5J2Q8NH18 312 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 SPACA7Q96KW9 195 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 PRODH2Q9UF12 536 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 CYP8B1Q9UNU6 501 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF337Q9Y3M9 751 aa17.97■□□□□ 0.47
SPNS1-201ENST00000311008 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms