RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PDCD10Q9BUL8 212 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CD93Q9NPY3 652 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PRAMEF25A6NGN4 478 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PAHP00439 452 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TCRBP04435 133 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ALAS2P22557 587 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 RORAP35398 523 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 GZMKP49863 264 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 FCRLBQ6BAA4 426 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 FAM109AQ8N4B1 249 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PFN4Q8NHR9 129 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 THEM6Q8WUY1 208 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 HMGB4Q8WW32 186 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 RADILQ96JH8 1075 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CYSLTR2Q9NS75 346 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 B3GNT2Q9NY97 397 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 KCNE3Q9Y6H6 103 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 E9PQ18 207 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 FCMRO60667 390 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SEMA4FO95754 770 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ATP1B1P05026 303 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 IFI6P09912 130 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ZNF24P17028 368 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PRKCAP17252 672 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PGCP20142 388 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 HHEXQ03014 270 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CRMP1Q14194 572 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ALG10Q5BKT4 473 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ZNF425Q6IV72 752 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 OR6N2Q8NGY6 317 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 GAL3ST4Q96RP7 486 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MIXL1Q9H2W2 232 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 HSPB2A8KAH6 182 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 BRINP1O60477 761 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 RDH16O75452 317 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 STARP49675 285 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 DYRK1AQ13627 763 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 HSPB2Q16082 182 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZSR6 202 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CHMP1BQ7LBR1 199 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MRGPREQ86SM8 312 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 GHDCQ8N2G8 530 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 FBXL6Q8N531 539 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 AMER3Q8N944 861 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 METTL21AQ8WXB1 218 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ZDHHC12Q96GR4 267 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CHIAQ9BZP6 476 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SLC19A3Q9BZV2 496 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 FGF22Q9HCT0 170 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PLCL2Q9UPR0 1127 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SERINC4A6NH21 518 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PLPP2O43688 288 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 OR7A10O76100 309 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 GIFP27352 417 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SOX18P35713 384 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CLDN2P57739 230 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 DCAF7P61962 342 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 BTN2A1Q7KYR7 527 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CEP76Q8TAP6 659 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 NECTIN4Q96NY8 510 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 A0A0G2JMP0 313 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 A0A0X1KG70 313 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 DISC1C4P0D8 188 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 C5orf67F2Z3F1 127 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 PEX14O75381 377 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 RP2O75695 350 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SLC2A10O95528 541 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CA3P07451 260 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CALCBP10092 127 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 CTXN1P60606 82 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 RAB11BQ15907 218 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ZNF79Q15937 498 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A25Q6KCM7 469 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 ELMOD2Q8IZ81 293 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 BBS1Q8NFJ9 593 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-201ENST00000264345 OR4M2Q8NGB6 313 aa8.18□□□□□ -1.1
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