RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 ORAI1Q96D31 301 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 MPP4Q96JB8 637 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 OSGIN1Q9UJX0 560 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 MED31Q9Y3C7 131 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 SNX5Q9Y5X3 404 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 DCHS2Q6V1P9 2916 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 A0A0B4J2E0 115 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 A0A1B0GX12 115 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 AHCYL1O43865 530 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 LYPD3O95274 346 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 TFPIP10646 304 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 WT1P19544 449 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 PYCR1P32322 319 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 EVI2BP34910 448 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 HOXD12P35452 270 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 NR1H2P55055 460 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 CDC42P60953 191 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 MXD1Q05195 221 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF91Q05481 1191 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ATP1A4Q13733 1029 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 FGFBP1Q14512 234 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 MELKQ14680 651 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 QPRTQ15274 297 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ETFDHQ16134 617 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 RFX4Q33E94 735 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ELOA3BQ3SY89 546 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 SYT14P1Q58G82 188 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 SLC6A19Q695T7 634 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 SLC27A4Q6P1M0 643 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 RPTNQ6XPR3 784 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ELOA3Q8NG57 546 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 OR6K6Q8NGW6 343 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 GATAD2BQ8WXI9 593 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 PLEKHA8Q96JA3 519 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 FUNDC2Q9BWH2 189 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 TCFL5Q9UL49 500 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 TVP23AA6NH52 213 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 C9J4A7 227 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 H0YJX3 145 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 RAMP1O60894 148 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ADAP00813 363 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 FTH1P19P0C7X4 201 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 FGF5P12034 268 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ACP1P24666 158 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 STARP49675 285 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 SKP2Q13309 424 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 AQP6Q13520 282 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 CMPK2Q5EBM0 449 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 BROXQ5VW32 411 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 KMT5CQ86Y97 462 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF511Q8NB15 262 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 OR51E2Q9H255 320 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 METTL7AQ9H8H3 244 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 MMACHCQ9Y4U1 282 aa5.99□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 TNFRSF10AO00220 468 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 LALBAP00709 142 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 PNLIPP16233 465 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 BMP7P18075 431 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 GABRB1P18505 474 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 IFNA8P32881 189 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 CENPAP49450 140 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 PCYT1AP49585 367 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 PCOLCEQ15113 449 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 DTX3Q8N9I9 347 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 FANK1Q8TC84 345 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 PTP4A1Q93096 173 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 TAAR8Q969N4 342 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 NRBF2Q96F24 287 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 IER2Q9BTL4 223 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 KATNB1Q9BVA0 655 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 MGAT4BQ9UQ53 548 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 PCSK5Q92824 1860 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 ANKRD61A6NGH8 418 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 SAGE2PA6NJ88 616 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 SYT5O00445 386 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 NKX2-8O15522 239 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 RGS10O43665 173 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 EFNA2O43921 213 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 TSPAN2O60636 221 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 RAD1O60671 282 aa5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CNIH1-201ENST00000216416 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.3 ms