RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061209.6

Ccdc71-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dtwd2Q9D0U1 298 aa11.97□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Clec2gQ9D676 269 aa11.97□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 MycbpQ9EQS3 103 aa11.97□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cpn1Q9JJN5 457 aa11.97□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dkk3Q9QUN9 349 aa11.97□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ighv15-2A0A0A6YX72 118 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm37596A0A0A6YXL2 336 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm5678A0A1B0GRG8 277 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem229aB9EJI9 371 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr31E9Q3K2 317 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr66F8VQ01 311 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn2r95L7N274 845 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Emp3O35912 163 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pip5k1cO70161 661 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hmox2O70252 315 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hcn1O88704 910 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gstm3P19639 218 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Copz1P61924 177 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cmklr1P97468 371 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Prelid2Q0VBB0 177 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gpat2Q14DK4 801 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mtch2Q791V5 303 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr290Q7TS13 315 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slitrk2Q810C0 846 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sult2a8Q8BGL3 282 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 1700001C19RikQ8K168 210 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 LzicQ8K3C3 190 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr651Q8VG78 313 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmp1Q99KU0 406 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nkx6-1Q99MA9 365 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Msantd3Q9CR78 275 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 P2rx4Q9JJX6 388 aa11.96□□□□□ -0.49
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 TriqkB2B9E1 86 aa11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cdh19E9Q3A7 770 aa11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm10639E9Q6L7 222 aa11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tlx3O55144 291 aa11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mtnd1P03888 318 aa11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Isl1P61372 349 aa11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rab26Q504M8 260 aa11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 BC061237Q6P8I2 184 aa11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Syt16Q7TN83 639 aa11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cpeb4Q7TN98 729 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Lrrtm2Q8BGA3 515 aa11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Krtcap3Q8K177 240 aa11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Armcx6Q8K3A6 301 aa11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 St3gal4Q91Y74 333 aa11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Wwtr1Q9EPK5 395 aa11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pole3Q9JKP7 145 aa11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 MyofQ69ZN7 2048 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trbc2A0A075B5J4 173 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm5407E9Q7Q1 248 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nme6O88425 189 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 P01851 173 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nrsn1P97799 196 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Faap20Q3UN58 186 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 D13Ertd608eQ3UPR8 151 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 IfneQ80ZF2 192 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slitrk5Q810B7 957 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Znf771Q8BJ90 317 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Plekhm3Q8BM47 761 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Znf322Q8BZ89 410 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Q8K207 121 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ceacam20Q9D2Z1 577 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pla2g12aQ9EPR2 192 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ndufa13Q9ERS2 144 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rgs1Q9JL25 209 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nxt1Q9QZV9 140 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 IsxA1A546 240 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp563B8JJZ9 448 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Macc1E9PXX8 851 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn2r91E9Q2U5 856 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Esp36G3UZD8 160 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vti1bO88384 232 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dcaf7P61963 342 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Eml4Q3UMY5 988 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 BocQ6AZB0 1110 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rcn3Q8BH97 328 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Clec4gQ8BNX1 294 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 BmfQ91ZE9 185 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Asb6Q91ZU1 418 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Taf11Q99JX1 211 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Adad2Q9D5P4 478 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Spata19Q9DAQ9 154 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr71Q9QZ18 312 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 ChmlQ9QZD5 621 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 A0A286YD17 136 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr740E9PV79 311 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn1r27K7N688 303 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Prl8a2O54832 240 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rps15P62843 145 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 BC080695Q66JY9 481 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sgpp2Q810K3 354 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cxcl16Q8BSU2 246 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ndrg4Q8BTG7 352 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kcnk10Q8BUW1 535 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Acp7Q8BX37 438 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Apoa5Q8C7G5 368 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Il17rcQ8K4C2 698 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mmd2Q8R189 247 aa11.95□□□□□ -0.5
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr1389Q8VGX0 311 aa11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.3 ms