RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518290.1

ARFGEF1-204, Transcript of ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARFGEF1, Length 3,179 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1-204ENST00000518290 RNFT2Q96EX2 444 aa7.35□□□□□ -1.23
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ARFGEF1-204ENST00000518290 IL4I1Q96RQ9 567 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 VN1R1Q9GZP7 353 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.35□□□□□ -1.23
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ARFGEF1-204ENST00000518290 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.35□□□□□ -1.23
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ARFGEF1-204ENST00000518290 NPIPB7O75200 414 aa7.35□□□□□ -1.23
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ARFGEF1-204ENST00000518290 TNNI3P19429 210 aa7.35□□□□□ -1.23
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ARFGEF1-204ENST00000518290 PERM1Q5SV97 790 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 C5orf46Q6UWT4 87 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 Q7L0L9 218 aa7.35□□□□□ -1.23
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ARFGEF1-204ENST00000518290 TMEM151BQ8IW70 566 aa7.35□□□□□ -1.23
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ARFGEF1-204ENST00000518290 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 NUDT9Q9BW91 350 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 LRRN3Q9H3W5 708 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 MARCH7Q9H992 704 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.35□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 SEC14L5O43304 696 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 GPX5O75715 221 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 SC5DO75845 299 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 UTS2O95399 124 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 NADKO95544 446 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 NTN1O95631 604 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 PEPDP12955 493 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 SLC1A3P43003 542 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 SLC25A1P53007 311 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.235e-7■□□□□ 8.6
ARFGEF1-204ENST00000518290 KCNJ8Q15842 424 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 SNAPC1Q16533 368 aa7.34□□□□□ -1.23
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ARFGEF1-204ENST00000518290 APCDD1LQ8NCL9 501 aa7.34□□□□□ -1.23
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ARFGEF1-204ENST00000518290 ZNF337Q9Y3M9 751 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 SCN2AQ99250 2005 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 SIGLEC6O43699 453 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 CER1O95813 267 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 SLC6A6P31641 620 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 HOXC5Q00444 222 aa7.34□□□□□ -1.23
ARFGEF1-204ENST00000518290 ALG10BQ5I7T1 473 aa7.34□□□□□ -1.23
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