RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509165.1

NFKB1-208, Transcript of nuclear factor kappa B subunit 1, human

TSL 5

Gene NFKB1, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFKB1-208	ENST00000509165	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	C4orf45	Q96LM5	186 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	TTC25	Q96NG3	672 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	SMIM14	Q96QK8	99 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	NAT9	Q9BTE0	207 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	LRRC61	Q9BV99	259 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	DPH5	Q9H2P9	285 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	NT5M	Q9NPB1	228 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	SMOX	Q9NWM0	555 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	ITM2B	Q9Y287	266 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		3.36	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165		A0A1W2PPR1	153 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	MAGEB16	A2A368	324 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	IGLON5	A6NGN9	336 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	CHUK	O15111	745 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	YKT6	O15498	198 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	RIPK2	O43353	540 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	DFNA5	O60443	496 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	SPAG6	O75602	509 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	ANXA9	O76027	345 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	AP2A1	O95782	977 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	IFNB1	P01574	187 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	FGF1	P05230	155 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	CSN3	P07498	182 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	ETS1	P14921	441 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	HLA-DPA1	P20036	260 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	CD22	P20273	847 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	PSMB4	P28070	264 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	SHC1	P29353	583 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	CD86	P42081	329 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	MAGEA4	P43358	317 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	GEM	P55040	296 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	XIAP	P98170	497 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	BCL2L1	Q07817	233 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	VEZF1	Q14119	521 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	PTPRCAP	Q14761	206 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	IRF4	Q15306	451 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	ISX	Q2M1V0	245 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	LRRC66	Q68CR7	880 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	KCTD16	Q68DU8	428 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	MACC1	Q6ZN28	852 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	CENPU	Q71F23	418 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	CACUL1	Q86Y37	369 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	BBS5	Q8N3I7	341 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	AVL9	Q8NBF6	648 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	CCNY	Q8ND76	341 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	MOB3A	Q96BX8	217 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	SERPINB12	Q96P63	405 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	VPS35	Q96QK1	796 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	RANBP9	Q96S59	729 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	FEV	Q99581	238 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	OMD	Q99983	421 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	CCDC77	Q9BR77	488 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	ABCG8	Q9H221	673 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	TRABD	Q9H4I3	376 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	HACD3	Q9P035	362 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	IL17C	Q9P0M4	197 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	VPS18	Q9P253	973 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	CHKB	Q9Y259	395 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		3.35	□□□□□ -1.87
NFKB1-208	ENST00000509165		U3KQA8	63 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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