RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 SERINC4A6NH21 518 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 C16orf97H3BN30 126 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 TM9SF1O15321 606 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 SYNGR4O95473 234 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 NUDT14O95848 222 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 TUBBP07437 444 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 CD8BP10966 210 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF17P17021 662 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 PRKCAP17252 672 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 UQCRC2P22695 453 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 CRYGSP22914 178 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 EPHA3P29320 983 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 LCN1P31025 176 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 PEX19P40855 299 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 KCNJ5P48544 419 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 LTBQ06643 244 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 KEAP1Q14145 624 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 QPRTQ15274 297 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 MAPK11Q15759 364 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF141Q15928 474 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 SYPL1Q16563 259 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 SMU1Q2TAY7 513 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 HHATQ5VTY9 493 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 SAXO2Q658L1 398 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 NATD1Q8N6N6 113 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ANKFN1Q8N957 763 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 OR8J2Q8NGG1 315 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 OR5W2Q8NH69 310 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 NINJ1Q92982 152 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 KLHL15Q96M94 604 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 LAT2Q9GZY6 243 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 TMBIM4Q9HC24 238 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 AIG1Q9NVV5 245 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 NDRG3Q9UGV2 375 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 DSCAMO60469 2012 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ROS1P08922 2347 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 CCDC154A6NI56 674 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF814B7Z6K7 855 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 HMGN4O00479 90 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF264O43296 627 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 RAMP1O60894 148 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 RAF1P04049 648 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 CCNA2P20248 432 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 RAB6AP20340 208 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 AGTR1P30556 359 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 HOXC12P31275 282 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 S100A3P33764 101 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 NTF4P34130 210 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 RYKP34925 604 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 PGM1P36871 562 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 CCR4P51679 360 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 CTBP2P56545 445 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 SESN3P58005 492 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 SKP2Q13309 424 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 GTDC1Q4AE62 458 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC25A53Q5H9E4 307 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 RNF130Q86XS8 419 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 MISPQ8IVT2 679 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF527Q8NB42 609 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 MOAP1Q96BY2 351 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF4B-208ENST00000490653 ROPN1LQ96C74 230 aa6.5□□□□□ -1.37
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