RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 FAM153BP0C7A2 387 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 CCT5P48643 541 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 GPR68Q15743 365 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 FAM153CQ494X1 144 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 KANK2Q63ZY3 851 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 C10orf107Q8IVU9 208 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 OR5AK3PQ8NH89 298 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 OR5P2Q8WZ92 322 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 OR7D2Q96RA2 312 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 SDF2Q99470 211 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 C19orf24Q9BVV8 132 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 LAT2Q9GZY6 243 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.92□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 SERINC4A6NH21 518 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 TMEM233B4DJY2 109 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 H7C417 338 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 TFPIP10646 304 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 USF1P22415 310 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 NTF4P34130 210 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 CRHR1P34998 444 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 SKP2Q13309 424 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 SYT14P1Q58G82 188 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 IL17RELQ6ZVW7 336 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 OLIG3Q7RTU3 272 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 MNS1Q8NEH6 495 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 PROX1Q92786 737 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 APH1AQ96BI3 265 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 INPP5KQ9BT40 448 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 ASB6Q9NWX5 421 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 EMC3Q9P0I2 261 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 KCNE5Q9UJ90 142 aa14.91□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 TMEM114B3SHH9 223 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 PIP5K1BO14986 540 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 CFLARO15519 480 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 PEX11AO75192 247 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 CSTAP01040 98 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 IGFBP5P24593 272 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 EFNA4P52798 201 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 RPS26P62854 115 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 PDK3Q15120 406 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF544Q6NX49 715 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 TWIST2Q8WVJ9 160 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 ST8SIA1Q92185 356 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 CHODLQ9H9P2 273 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.9□□□□□ -0.02
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF716A6NP11 495 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 COPEO14579 308 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 FCMRO60667 390 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 DNAJA2O60884 412 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 CHRNGP07510 517 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 SRD5A1P18405 259 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 PTGR1Q14914 329 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF141Q15928 474 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 GABRA6Q16445 453 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 UGT3A2Q3SY77 523 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC103Q8IW40 242 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 SFXN5Q8TD22 340 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 TMEM234Q8WY98 164 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 ARL5BQ96KC2 179 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 MUS81Q96NY9 551 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 C1orf50Q9BV19 199 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 NMUR2Q9GZQ4 415 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 CTPS2Q9NRF8 586 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 ACER3Q9NUN7 267 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 MKLN1Q9UL63 735 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.89□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 SLC35F4A4IF30 521 aa14.88□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 SMIM23A6NLE4 172 aa14.88□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 TRIM13O60858 407 aa14.88□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 ITGA5P08648 1049 aa14.88□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 CSF3P09919 207 aa14.88□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 PGCP20142 388 aa14.88□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 MATN1P21941 496 aa14.88□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 MAPK1P28482 360 aa14.88□□□□□ -0.03
TOP3B-217ENST00000489581 THBS2P35442 1172 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms