RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 PPT1P50897 306 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ACTR3P61158 418 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 SRYQ05066 204 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 PDK3Q15120 406 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 PDGFRLQ15198 375 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ATF7IP2Q5U623 682 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF562Q6V9R5 426 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 LUZP1Q86V48 1076 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 VPS36Q86VN1 386 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 OR4N5Q8IXE1 308 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC22A15Q8IZD6 547 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 CMTM8Q8IZV2 173 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKFN1Q8N957 763 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 AKR7LQ8NHP1 331 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR174Q9BXC1 333 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 CXCL16Q9H2A7 254 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ALG9Q9H6U8 611 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 DCTPP1Q9H773 170 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 MED20Q9H944 212 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ELOVL3Q9HB03 270 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 LPAR2Q9HBW0 351 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 APMAPQ9HDC9 416 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 RAB18Q9NP72 206 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR83Q9NYM4 423 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF14Q9UBS8 474 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 TMED5Q9Y3A6 229 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 WIPI2Q9Y4P8 454 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 FKBP7Q9Y680 259 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 SELENOKQ9Y6D0 94 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 MXRA5Q9NR99 2828 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ANK2Q01484 3957 aa4.76□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1W2PR80 420 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 MFSD2BA6NFX1 497 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ALOX15BO15296 676 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 CAPN1P07384 714 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 PAX1P15863 534 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 NT5EP21589 574 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 GIFP27352 417 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 PEX19P40855 299 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ID1P41134 155 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 BRCC3P46736 316 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ART1P52961 327 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 CDKL1Q00532 357 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 KLRB1Q12918 225 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC17A1Q14916 467 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 TATDN3Q17R31 274 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 KLHL40Q2TBA0 621 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 C1orf189Q5VU69 101 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 SEL1L3Q68CR1 1132 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 P4HA3Q7Z4N8 544 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 PARGQ86W56 976 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 LACC1Q8IV20 430 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 MAB21L3Q8N8X9 362 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 POC1AQ8NBT0 407 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 OR5AU1Q8NGC0 362 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ADIPOR1Q96A54 375 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC77Q9BR77 488 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 OVOL2Q9BRP0 275 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR61Q9BZJ8 451 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 RHOJQ9H4E5 214 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 METTL7AQ9H8H3 244 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ZFP57Q9NU63 452 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 C1orf123Q9NWV4 160 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 IKZF3Q9UKT9 509 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 TCF19Q9Y242 345 aa4.75□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 TTC26A0AVF1 554 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 LAD1O00515 517 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ARPC3O15145 178 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF208O43345 1280 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 TRMUO75648 421 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 FHP07954 510 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 CCNCP24863 283 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 TNFSF9P41273 254 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 TFDP1Q14186 410 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 MTF1Q14872 753 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 TAB1Q15750 504 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 SYT10Q6XYQ8 523 aa4.74□□□□□ -1.65
STRADBP1-201ENST00000478954 DPY19L4Q7Z388 723 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms