RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 CTAGE5O15320 804 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 SNAI2O43623 268 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 CSF2P04141 144 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 TPSB2P20231 275 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 IL1RL1Q01638 556 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 TPSAB1Q15661 275 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 C12orf60Q5U649 245 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 CNSTQ6PJW8 725 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 ARSKQ6UWY0 536 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 SVOPLQ8N434 492 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 KIR3DL3Q8N743 410 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 WDR76Q9H967 626 aa4.1□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 RLFQ13129 1914 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 CLDN5O00501 218 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 FAM189A1O60320 539 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 OR10H3O60404 316 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 UGT2B17O75795 530 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 TNNI3P19429 210 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 LEPP41159 167 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 LHX2P50458 406 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 HSPA2P54652 639 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 PDZK1IP1Q13113 114 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 RABGAP1LQ5R372 815 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 ZNF691Q5VV52 312 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 ZNF429Q86V71 674 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 MDS2Q8NDY4 140 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 OR8H1Q8NGG4 311 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 RAPGEF5Q92565 580 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 C12orf66Q96MD2 445 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 TSG101Q99816 390 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 RASL11BQ9BPW5 248 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 SLC25A22Q9H936 323 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 KIF25Q9UIL4 384 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 FRMPD4Q14CM0 1322 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 GPRASP1Q5JY77 1395 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 SMARCA2P51531 1590 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-210ENST00000472326 G3V4G9 280 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 ARHGEF11O15085 1522 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 MSH4O15457 936 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 PGCP20142 388 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 TBXA2RP21731 343 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 ACP7Q6ZNF0 438 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 RFLNAQ6ZTI6 216 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 TPRA1Q86W33 373 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 PNKDQ8N490 385 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 PIGCQ92535 297 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 NESP48681 1621 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 E7ESA3 106 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 ATP6V1B2P21281 511 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 PSMA2P25787 234 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 HPCAL1P37235 193 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 CCR6P51684 374 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 TGFBR3Q03167 851 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 RNF185Q96GF1 192 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 KCNA7Q96RP8 456 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 RHBGQ9H310 441 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 VCPKMTQ9H867 229 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 CYTL1Q9NRR1 136 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 ODF2LQ9ULJ1 636 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 ERVW-1Q9UQF0 538 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 ASF1AQ9Y294 204 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 TNFSF13O75888 250 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 NEBLO76041 1014 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 MOSP00540 346 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 KLK7P49862 253 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 PLA2G16P53816 162 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 SELENOTP62341 195 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 ARL6IP1Q15041 203 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 CASC10Q5T4H9 136 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 MEAF6Q9HAF1 191 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 AIPL1Q9NZN9 384 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 GNG12Q9UBI6 72 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 SCRIBQ14160 1630 aa4.06□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.05□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 LGI1O95970 557 aa4.05□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 P04436 131 aa4.05□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 TRIM16LQ309B1 348 aa4.05□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa4.05□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa4.05□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 TMEM158Q8WZ71 300 aa4.05□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 OR2M2Q96R28 347 aa4.05□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa4.05□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 VCXQ9H320 206 aa4.05□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 PLGRKTQ9HBL7 147 aa4.05□□□□□ -1.76
SGCE-210ENST00000472326 PSG11Q9UQ72 335 aa4.05□□□□□ -1.76
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