RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 PTOV1Q86YD1 416 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 C10orf82Q8WW14 230 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 C14orf79Q96F83 325 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ARL5BQ96KC2 179 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 LURAP1Q96LR2 239 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TM9SF2Q99805 663 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC106Q9BWC9 280 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 LIME1Q9H400 295 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 RMND5AQ9H871 391 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 GALNT8Q9NY28 637 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 P2RX2Q9UBL9 471 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 LIPT1Q9Y234 373 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 GMEB1Q9Y692 573 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 MED13LQ71F56 2210 aa6.26□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ROS1P08922 2347 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM72A0PK05 275 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CDHR4A6H8M9 788 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TPST2O60704 377 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 PGM3O95394 542 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 IMPDH2P12268 514 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 GPX2P18283 190 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 PGCP20142 388 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 GCKP35557 465 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ARFIP2P53365 341 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CARD18P57730 90 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 MERTKQ12866 999 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 BNIP2Q12982 314 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 KLF10Q13118 480 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SERPINA11Q86U17 422 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ABHD3Q8WU67 409 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD27Q96NW4 1050 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CGREF1Q99674 301 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAM19Q9H013 955 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 A4GALTQ9NPC4 353 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SAR1AQ9NR31 198 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF175Q9Y473 711 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CREBBPQ92793 2442 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0G2JPF8 293 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 FXYD1O00168 92 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 MSTNO14793 375 aa6.24□□□□□ -1.41
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RABGEF1-206ENST00000461017 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 IL7RP16871 459 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ELK4P28324 431 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 AGTR1P30556 359 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 KIR2DL3P43628 341 aa6.24□□□□□ -1.41
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RABGEF1-206ENST00000461017 SEC24CP53992 1094 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CRISP3P54108 245 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 MTPNP58546 118 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 RAC3P60763 192 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
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