RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423855.6

RNPC3-201, Transcript of RNA binding region (RNP1, RRM) containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNPC3, Length 1,872 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3-201ENST00000423855 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa8.5□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.5□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 UBQLN4Q9NRR5 601 aa8.5□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 RASSF1Q9NS23 344 aa8.5□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 SCN3BQ9NY72 215 aa8.5□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 B4DXG7 233 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 PTGES3LE9PB15 166 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 OIP5O43482 229 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 TRMUO75648 421 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 OR5F1O95221 314 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 POU2F1P14859 743 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 NAGAP17050 411 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 ITGA3P26006 1051 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 LCN1P31025 176 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 EVI2BP34910 448 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 TMED10P49755 219 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 SSR4P51571 173 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 MVKQ03426 396 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 IRF3Q14653 427 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 TRAM2Q15035 370 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 BICRALQ6AI39 1079 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 ZNF227Q86WZ6 799 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 BEST3Q8N1M1 668 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 GALNT16Q8N428 558 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 SLC15A4Q8N697 577 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 GATSQ8NAP1 163 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 FAM71CQ8NEG0 241 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 FAM81AQ8TBF8 368 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 GRHL3Q8TE85 626 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 GGHQ92820 318 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 EVA1AQ9H8M9 152 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 SLC25A19Q9HC21 320 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 POLHQ9Y253 713 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 TPRP12270 2363 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 SH3D21A4FU49 640 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 SERINC4A6NH21 518 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 CLCA1A8K7I4 914 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 ALG1L2C9J202 215 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 H3BMQ9 156 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 RGS10O43665 173 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 OR10H3O60404 316 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 MPZL2O60487 215 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 FMO6PO60774 539 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 FAM20BO75063 409 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 INMTO95050 263 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 ATE1O95260 518 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 PRG2P13727 222 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 OMPP47874 163 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 UGT2B15P54855 530 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 RRADP55042 308 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 SOX8P57073 446 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 HOXC5Q00444 222 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 CDK5Q00535 292 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 TLE3Q04726 772 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 ST3GAL3Q11203 375 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 EFR3AQ14156 821 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 GPR107Q5VW38 600 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 TMEM236Q5W0B7 351 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 OPN5Q6U736 354 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 IL20RBQ6UXL0 311 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 GDF7Q7Z4P5 450 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 OIT3Q8WWZ8 545 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 ASB15Q8WXK1 588 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 YIPF6Q96EC8 236 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 COG8Q96MW5 612 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 KLHDC3Q9BQ90 382 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 SH2D2AQ9NP31 389 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 ANKRD10Q9NXR5 420 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 KLHL28Q9NXS3 571 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 MPDZO75970 2070 aa8.49□□□□□ -1.05
RNPC3-201ENST00000423855 NCKAP5O14513 1909 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms