RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 LRP5O75197 1615 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF195O14628 629 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 B4GALT3O60512 393 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 NCR1O76036 304 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ILKQ13418 452 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR50Q13585 617 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF77Q15935 545 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 VASNQ6EMK4 673 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 PARM1Q6UWI2 310 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 SYNPRQ8TBG9 265 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 TOMM40LQ969M1 308 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 MAP3K3Q99759 626 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 NUDT22Q9BRQ3 303 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 GABRPO00591 440 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 SNAPC5O75971 98 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC22A5O76082 557 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 APOC3P02656 99 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 OR8G3PP0DMU2 310 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 RGS19P49795 217 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 METRNLQ641Q3 311 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP1R3BQ86XI6 285 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC28AQ8IWP9 274 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 VN1R2Q8NFZ6 395 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 CENPOQ9BU64 300 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 PCDH10Q9P2E7 1040 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 CTHP32929 405 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ZMYND11Q15326 602 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA1211LQ6NV74 962 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC48A1Q6P1K1 146 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 HHLA2Q9UM44 414 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 GJE1A6NN92 205 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 H7C1C5 153 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ARPC5O15511 151 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 LCN6P62502 163 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 GSG1LQ6UXU4 331 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 OR13H1Q8NG92 308 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 OR51T1Q8NGJ9 327 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ELP4Q96EB1 424 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ASB4Q9Y574 426 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 MAST2Q6P0Q8 1798 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 A6NL46 340 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 HOXA9P31269 272 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC1A3P43003 542 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 DUSP19Q8WTR2 217 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 OR1E3Q8WZA6 343 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 SPTSSAQ969W0 71 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ITPKCQ96DU7 683 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ELOVL3Q9HB03 270 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 SAGE1Q9NXZ1 904 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 REV1Q9UBZ9 1251 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 COL18A1P39060 1754 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 MEIOCA2RUB1 952 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 GFYI3L273 518 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ACOT7O00154 380 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 GFRA2O00451 464 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ZFAND5O76080 213 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 AGTR1P30556 359 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A0G2JMP0 313 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC16A6O15403 523 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 AQP2P41181 271 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 VASPP50552 380 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF709Q8N972 641 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 OR4M2Q8NGB6 313 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 OLIG1Q8TAK6 271 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ENY2Q9NPA8 101 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 H0Y8X5 98 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD28O15084 1053 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 GIFP27352 417 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 MECP2P51608 486 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 RPL19P84098 196 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 SPOCK1Q08629 439 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ECH1Q13011 328 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 CRMP1Q14194 572 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR139Q6DWJ6 353 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM38AQ9H6F2 299 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 TFP02787 698 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ARSBP15848 533 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC6A19Q695T7 634 aa16.02■□□□□ 0.16
SH3BP4-202ENST00000392011 ADIPOR2Q86V24 386 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms