RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 GPR32P1Q8NGA4 272 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SMPDL3AQ92484 453 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 RGMAQ96B86 450 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ELP4Q96EB1 424 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 NDC1Q9BTX1 674 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 MTG2Q9H4K7 406 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ZMAT4Q9H898 229 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 NLGN3Q9NZ94 848 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 DEC1Q9P2X7 70 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA2Q9UM82 520 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0G2JPF8 293 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 H0YC42 278 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 AIPO00170 330 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 PLPP2O43688 288 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SULT1B1O43704 296 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF205O95201 554 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 MPC2O95563 127 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ETHE1O95571 254 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TFP02787 698 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 IL5P05113 134 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 IL3P08700 152 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 FGF2P09038 288 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 FCARP24071 287 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 FPR3P25089 353 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 GIFP27352 417 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 CBX5P45973 191 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 MAP2K6P52564 334 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ARFIP1P53367 373 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 CAV3P56539 151 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 BTN1A1Q13410 526 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 RUNX3Q13761 415 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SLC36A2Q495M3 483 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 EOGTQ5NDL2 527 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 C6orf120Q7Z4R8 191 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 IQCHQ86VS3 1027 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SLC43A2Q8N370 569 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 STPG2Q8N412 459 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 MORN4Q8NDC4 146 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 OR2T33Q8NG76 320 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 OR8D4Q8NGM9 314 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 YIPF5Q969M3 257 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL15Q96M94 604 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SFXN2Q96NB2 322 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 EPHX3Q9H6B9 360 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 CD207Q9UJ71 328 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 DOCK8Q8NF50 2099 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 MYOFQ9NZM1 2061 aa6.67□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2QL1A1L167 161 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 CD8B2A6NJW9 211 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 MPTX1A8MV57 137 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 ANHXE9PGG2 379 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 SURF4O15260 269 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 PI15O43692 258 aa6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CTPS1-201ENST00000372616 EGFP01133 1207 aa6.66□□□□□ -1.34
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