RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354497.4

RTN3-204, Transcript of reticulon 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RTN3, Length 1,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3-204ENST00000354497 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RTN3-204ENST00000354497 C12orf49Q9H741 205 aa10□□□□□ -0.81
RTN3-204ENST00000354497 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
RTN3-204ENST00000354497 HMG20AQ9NP66 347 aa10□□□□□ -0.81
RTN3-204ENST00000354497 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa10□□□□□ -0.81
RTN3-204ENST00000354497 MYRFQ9Y2G1 1151 aa10□□□□□ -0.81
RTN3-204ENST00000354497 AP3M1Q9Y2T2 418 aa10□□□□□ -0.81
RTN3-204ENST00000354497 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
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RTN3-204ENST00000354497 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RTN3-204ENST00000354497 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
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RTN3-204ENST00000354497 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
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RTN3-204ENST00000354497 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
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RTN3-204ENST00000354497 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
RTN3-204ENST00000354497 NGBQ9NPG2 151 aa9.99□□□□□ -0.81
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RTN3-204ENST00000354497 SYNGR4O95473 234 aa9.98□□□□□ -0.81
RTN3-204ENST00000354497 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
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RTN3-204ENST00000354497 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.98□□□□□ -0.81
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RTN3-204ENST00000354497 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RTN3-204ENST00000354497 THBS2P35442 1172 aa9.98□□□□□ -0.81
RTN3-204ENST00000354497 SLC9A3P48764 834 aa9.98□□□□□ -0.81
RTN3-204ENST00000354497 PRIM2P49643 509 aa9.98□□□□□ -0.81
RTN3-204ENST00000354497 BSPH1Q075Z2 132 aa9.98□□□□□ -0.81
RTN3-204ENST00000354497 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RTN3-204ENST00000354497 MGAT2Q10469 447 aa9.98□□□□□ -0.81
RTN3-204ENST00000354497 MAP4K2Q12851 820 aa9.98□□□□□ -0.81
RTN3-204ENST00000354497 CALCOCO2Q13137 446 aa9.98□□□□□ -0.81
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