RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 LACC1Q8IV20 430 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ULK2Q8IYT8 1036 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 MEIOBQ8N635 442 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 OR6T1Q8NGN1 323 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 CLPTM1LQ96KA5 538 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 SERINC1Q9NRX5 453 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 H0YC42 278 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 CCL21O00585 134 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 WDR1O75083 606 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 CCNA2P20248 432 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ACVR2AP27037 513 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 HTR2AP28223 471 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 HTR3AP46098 478 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 RASSF2P50749 326 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 BNIP2Q12982 314 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 FXNQ16595 210 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 C3orf33Q6P1S2 294 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 CBLL1Q75N03 491 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 FJX1Q86VR8 437 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 OR4D11Q8NGI4 311 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF559Q9BR84 538 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 SNX13Q9Y5W8 968 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM229AB2RXF0 380 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 EBAG9O00559 213 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ARPC2O15144 300 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 LRRTM2O43300 516 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 GABRA1P14867 456 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 OR1E2P47887 323 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 DLX5P56178 289 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 VTCN1Q7Z7D3 282 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 GGNQ86UU5 652 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 CARM1Q86X55 608 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 DOCK7Q96N67 2140 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 MCHR1Q99705 422 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM2Q9C040 744 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 GORASP2Q9H8Y8 452 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 CHRNA9Q9UGM1 479 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 OSGIN1Q9UJX0 560 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 RPS6KA6Q9UK32 745 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 TMED7Q9Y3B3 224 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 AHRRA9YTQ3 701 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 TPST2O60704 377 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 SHC1P29353 583 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 NPTX1Q15818 432 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC121Q6ZUS5 278 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 FKBP9P1Q75LS8 142 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 CHMP1BQ7LBR1 199 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ADGRG3Q86Y34 549 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 KLHL15Q96M94 604 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 NSMCE2Q96MF7 247 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 TUBA1CQ9BQE3 449 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ADAM19Q9H013 955 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM27Q9HBJ8 222 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 PRDM4Q9UKN5 801 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 MED12LQ86YW9 2145 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 FASNP49327 2511 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1B0GUH1 482 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 GJE1A6NN92 205 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 TNFSF11O14788 317 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 CXCR1P25024 350 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 SLC7A1P30825 629 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 CLDN15P56746 228 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 OR1Q1Q15612 314 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 C4orf17Q53FE4 359 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 C1orf185Q5T7R7 199 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 EID3Q8N140 333 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 RPRMLQ8N4K4 120 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 LSMEM1Q8N8F7 131 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 RNF217Q8TC41 542 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 C3orf49Q96BT1 292 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 HSH2DQ96JZ2 352 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 TRIB1Q96RU8 372 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 TENM4Q6N022 2769 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1B0GWA3 101 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 TFPIP10646 304 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 PTGER4P35408 488 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
HOXD4-201ENST00000306324 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms