RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 TPRKBQ9Y3C4 175 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 EML6Q6ZMW3 1958 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ADRA2AP08913 450 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SMSP52788 366 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 NEDD8Q15843 81 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 CASP12Q6UXS9 341 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 AHSA2Q719I0 299 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 CLDN22Q8N7P3 220 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 OR8J1Q8NGP2 316 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 OR13C2Q8NGS9 318 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TEX47Q8TBZ9 253 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 GGHQ92820 318 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 RASL10BQ96S79 203 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 TSSK6Q9BXA6 273 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SCN3BQ9NY72 215 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SIGLEC7Q9Y286 467 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 CDH10Q9Y6N8 788 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-201ENST00000284957 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 UNC119BA6NIH7 251 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 H3BSA7 217 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MPZL2O60487 215 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ENTPD6O75354 484 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PTP4A3O75365 173 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB40ALP0C0E4 278 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 NAGAP17050 411 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MASP1P48740 699 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PCYT1AP49585 367 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMD7P51665 324 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 GAS1P54826 345 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CSNK2BP67870 215 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM201Q5SNT2 666 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 BICRALQ6AI39 1079 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 DUSP19Q8WTR2 217 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 OSTF1Q92882 214 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SAMD8Q96LT4 415 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PRRX2Q99811 253 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 DEFB126Q9BYW3 111 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAM19Q9H013 955 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 OR52D1Q9H346 318 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 GALNT9Q9HCQ5 603 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MMP25Q9NPA2 562 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR83Q9NYM4 423 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SELENONQ9NZV5 590 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CEPT1Q9Y6K0 416 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 C2orf72A6NCS6 295 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CLCA1A8K7I4 914 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRN3E7EW58 273 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 FTH1P19P0C7X4 201 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 EGR4Q05215 589 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 EFR3AQ14156 821 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB39AQ14964 217 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 NDUFAF7Q7L592 441 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM26EQ8N5C1 309 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 M1APQ8TC57 530 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF160Q9HCG1 818 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 HHATLQ9HCP6 504 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D23Q9NUY8 699 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM5Q9Y2B1 443 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAV27A0A087WT01 109 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 MT-ND2P03891 347 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXO45P0C2W1 286 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 PTGDSP41222 190 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC1A3P43003 542 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC15A1P46059 708 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 EXT1Q16394 746 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5M10Q6IEU7 315 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC17Q8N6Y2 441 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 OR10G3Q8NGC4 313 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5W2Q8NH69 310 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC90BQ9GZT6 254 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 UBQLN3Q9H347 655 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR52Q9Y2T5 361 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 SH3D21A4FU49 640 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 BHLHE40O14503 412 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 ITGA10O75578 1167 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 TNFSF15O95150 251 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-201ENST00000284957 CH25HO95992 272 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms