RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CDH24Q86UP0 819 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMARCE1-201ENST00000264640 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMARCE1-201ENST00000264640 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMARCE1-201ENST00000264640 OR2L3Q8NG85 312 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMARCE1-201ENST00000264640 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMARCE1-201ENST00000264640 AP3S1Q92572 193 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ITFG2Q969R8 447 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MS4A6EQ96DS6 147 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2M4Q96R27 311 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 IL4I1Q96RQ9 567 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGDIGQ99819 225 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 NEURL2Q9BR09 285 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMARCE1-201ENST00000264640 MENTQ9BUN1 341 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 OR51E2Q9H255 320 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 RHCGQ9UBD6 479 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXW2Q9UKT8 454 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR37Q9Y2I8 494 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ASB4Q9Y574 426 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SCN3AQ9NY46 2000 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM129A0AVI4 362 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 HYKKA2RU49 373 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.48□□□□□ -1.37
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SMARCE1-201ENST00000264640 TBX1O43435 398 aa6.48□□□□□ -1.37
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SMARCE1-201ENST00000264640 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 B3GALT2O43825 422 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP7B1O75881 506 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 AIFM1O95831 613 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 IL1AP01583 271 aa6.48□□□□□ -1.37
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SMARCE1-201ENST00000264640 ACP2P11117 423 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 F3P13726 295 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CPN2P22792 545 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ITGA3P26006 1051 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 GIPRP48546 466 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 WNT4P56705 351 aa6.48□□□□□ -1.37
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SMARCE1-201ENST00000264640 CDK5Q00535 292 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNAB1Q14722 419 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 KIR2DS3Q14952 304 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 SEC23BQ15437 767 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 CEBPEQ15744 281 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MAPK11Q15759 364 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 DECR1Q16698 335 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 MINDY4Q4G0A6 757 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 HSDL2Q6YN16 418 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF793Q6ZN11 406 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ABHD13Q7L211 337 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 ASPGQ86U10 573 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 AKAP14Q86UN6 197 aa6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMARCE1-201ENST00000264640 AMIGO1Q86WK6 493 aa6.48□□□□□ -1.37
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