RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262067.4

TSPAN13-201, Transcript of tetraspanin 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN13, Length 2,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13-201ENST00000262067 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 PHF19Q5T6S3 580 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 WBP2NLQ6ICG8 309 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 B3GLCTQ6Y288 498 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 CROCCP3Q8IVE0 287 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 IDSB3KWA1 339 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 LRRN3E7EW58 273 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 J3QRK9 145 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 PPP1R3DO95685 299 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 CER1O95813 267 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 WNT4P56705 351 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 DCDP81605 110 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 LHFPL3Q86UP9 236 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 LRRC17Q8N6Y2 441 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF441Q8N8Z8 693 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 KBTBD8Q8NFY9 601 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF524Q96C55 264 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 KLHDC3Q9BQ90 382 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 OCIAD1Q9NX40 245 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 OR6C76A6NM76 312 aa21.98■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 HEXBP07686 556 aa21.98■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 PLCXD2Q0VAA5 305 aa21.98■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 LIPKQ5VXJ0 399 aa21.98■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 NIPAL3Q6P499 406 aa21.98■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ANKRD37Q7Z713 158 aa21.98■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 GID4Q8IVV7 300 aa21.98■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa21.98■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 GATAD2BQ8WXI9 593 aa21.98■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 PTP4A1Q93096 173 aa21.98■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 OMA1Q96E52 524 aa21.98■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 HEATR5AQ86XA9 2040 aa21.98■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 CD79BP40259 229 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 LPAL2Q16609 132 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 LINC00299Q6ZSB3 139 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 PHC2Q8IXK0 858 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 TM9SF4Q92544 642 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 NDUFB11Q9NX14 153 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ABCD3P28288 659 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 LCN1P31025 176 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC6A6P31641 620 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ATP6V1E1P36543 226 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC1A3P43003 542 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC23A3Q6PIS1 610 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 PPP1R3BQ86XI6 285 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 DTWD2Q8NBA8 298 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 HSPBAP1Q96EW2 488 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 BAIAP2Q9UQB8 552 aa21.97■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 MUC3AQ02505 3323 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 MST1P26927 711 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 CRYBB2P43320 205 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC9A3P48764 834 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ITGADQ13349 1161 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ELOA3BQ3SY89 546 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 OVCH1Q7RTY7 1134 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 MARCH3Q86UD3 253 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 SIRT6Q8N6T7 355 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC37A3Q8NCC5 494 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ELOA3Q8NG57 546 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 MCFD2Q8NI22 146 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 CTRCQ99895 268 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF649Q9BS31 505 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 LAT2Q9GZY6 243 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 AKIP1Q9NQ31 210 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 FBXO4Q9UKT5 387 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 RIIAD1A6NNX1 92 aa21.95■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 C17orf51A8MQB3 221 aa21.95■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 PPM1BO75688 479 aa21.95■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 IGHA1P01876 353 aa21.95■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 PEPDP12955 493 aa21.95■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 IDUAP35475 653 aa21.95■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF117Q03924 483 aa21.95■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 LCN10Q6JVE6 187 aa21.95■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF485Q8NCK3 441 aa21.95■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 OR51G2Q8NGK0 314 aa21.95■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 DTNBP1Q96EV8 351 aa21.95■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 SMOC1Q9H4F8 434 aa21.95■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 FBXO8Q9NRD0 319 aa21.95■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa21.95■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 SEC14L4Q9UDX3 406 aa21.95■■□□□ 1.11
TSPAN13-201ENST00000262067 METTL15A6NJ78 407 aa21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms