RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r172Q9EPS4 313 aa11.98□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdk20Q9JHU3 346 aa11.98□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dapp1Q9QXT1 280 aa11.98□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp68Q9Z116 606 aa11.98□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ilf3Q9Z1X4 898 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TprF6ZDS4 2431 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01669 111 aa11.98□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lire1P11260 357 aa11.98□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Msx1P13297 303 aa11.98□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcsk4P29121 655 aa11.98□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fpr1P33766 364 aa11.98□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf354aQ61751 572 aa11.98□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fpr-rs7Q71MR7 338 aa11.98□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8K207 121 aa11.98□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cbr3Q8K354 277 aa11.98□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr516Q8VFZ5 314 aa11.98□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr812Q8VG64 310 aa11.98□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr870Q8VGG4 311 aa11.98□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Exosc5Q9CRA8 235 aa11.98□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NynrinQ5DTZ0 1840 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SvaE9PX96 165 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm20390E9PZF0 267 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sult3a2G5E904 293 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acta2P62737 377 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnab1P63143 401 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Actg2P63268 376 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SgcdP82347 289 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klhl21Q3U410 597 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MthfsdQ3URQ7 372 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olig3Q6PFG8 273 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C8gQ8VCG4 202 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scgb3a1Q920D7 104 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdca4Q9CWM2 237 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rtl8cQ9D6I0 112 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r53Q9EP93 310 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nek7Q9ES74 302 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lgals8Q9JL15 316 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CrebbpP45481 2441 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam136b-psA0A140T8T1 138 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1076A2AK60 313 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam83cA2ARK0 776 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gfra2O08842 464 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Foxq1O70220 400 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 B3gat2P59270 324 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gabarapl2P60521 117 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc10a2P70172 348 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 B230104I21RikQ3USW4 141 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr140Q60878 302 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr3Q60879 313 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr146Q60884 306 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SpicQ6P3D7 242 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tas2r120Q7M721 295 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IlvblQ8BU33 632 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P2ry10bQ8BY68 352 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem268Q8R239 342 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r220Q8R272 298 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chchd4Q8VEA4 139 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EtfdhQ921G7 616 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rps21Q9CQR2 83 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zdhhc13Q9CWU2 622 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r35Q9D8C8 260 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr948Q9EQ95 321 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nrip3Q9JJR9 240 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RlimQ9WTV7 600 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr619E9PV95 320 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr723E9PZU2 309 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr724K7N5X7 309 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1360K9J6X0 313 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r28L7N203 852 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NumblO08919 604 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Best1O88870 551 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hsd3b1P24815 373 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Foxa1P35582 468 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tial1P70318 392 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdh10P70408 788 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1359Q7TQU5 313 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CyrenQ8BHZ5 157 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sesn3Q9CYP7 492 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il23aQ9EQ14 196 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Oaz3Q9R109 243 aa11.97□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igkv17-127A0A0G2JDN5 117 aa11.96□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1145A2AVC7 325 aa11.96□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Capns1O88456 269 aa11.96□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfand5O88878 213 aa11.96□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LckP06240 509 aa11.96□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nr2f6P43136 390 aa11.96□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Polr2iP60898 125 aa11.96□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Coro2bQ8BH44 480 aa11.96□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrgpra7Q91ZC5 305 aa11.96□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fastkd2Q922E6 689 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 D10Jhu81eQ9D172 266 aa11.96□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyb5r1Q9DB73 305 aa11.96□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snap29Q9ERB0 260 aa11.96□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MioxQ9QXN5 285 aa11.96□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm6880A3KG45 208 aa11.96□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pmm1O35621 262 aa11.96□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wsb2O54929 404 aa11.96□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fcgr1P26151 404 aa11.96□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NfkbidQ2TB02 327 aa11.96□□□□□ -0.49
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klra4Q60651 263 aa11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38 ms