RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	RAMP3	O60896	148 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	GPR32	O75388	356 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CA11	O75493	328 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ALDOB	P05062	364 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CEACAM5	P06731	702 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	EPHX1	P07099	455 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CSF3	P09919	207 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ITGB5	P18084	799 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	AQP2	P41181	271 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CDK8	P49336	464 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	KCNQ1	P51787	676 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	LIMK2	P53671	638 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PTTG1IP	P53801	180 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	RAG2	P55895	527 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CLDN20	P56880	219 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	MXD1	Q05195	221 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	MZT1	Q08AG7	82 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	HAGH	Q16775	308 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	SYT13	Q7L8C5	426 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM129C	Q86XR2	697 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072		Q8N402	240 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	BEST4	Q8NFU0	473 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC35C1	Q96A29	364 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	HHIP	Q96QV1	700 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	TBX5	Q99593	518 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	DDA1	Q9BW61	102 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ASPN	Q9BXN1	380 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ARL6	Q9H0F7	186 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	OR51J1	Q9H342	316 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	NANS	Q9NR45	359 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	GPR173	Q9NS66	373 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	NPTN	Q9Y639	398 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072		M0R143	59 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	AP4M1	O00189	453 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PHOX2A	O14813	284 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PMP2	P02689	132 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	NR3C1	P04150	777 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	MPL	P40238	635 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	MAGEA12	P43365	314 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PNLIPRP1	P54315	467 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	RAB1A	P62820	205 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CNTN1	Q12860	1018 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CRHR2	Q13324	411 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	IL11RA	Q14626	422 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PCLAF	Q15004	111 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	REEP3	Q6NUK4	255 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PXT1	Q8NFP0	134 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CD200R1	Q8TD46	325 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	THAP4	Q8WY91	577 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM234	Q8WY98	164 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	RAD54L	Q92698	747 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	FN3K	Q9H479	309 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	RERGL	Q9H628	205 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	RAB9B	Q9NP90	201 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	LHX9	Q9NQ69	397 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	C1orf109	Q9NX04	203 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	BHLHE40	O14503	412 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	RCBTB2	O95199	551 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	CST1	P01037	141 aa		5.73	□□□□□ -1.49
NECAP1-222	ENST00000640072	PIGR	P01833	764 aa		5.73	□□□□□ -1.49

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