RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538351.6

ZNF438-208, Transcript of zinc finger protein 438, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF438, Length 3,284 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF438-208	ENST00000538351	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	LIN54	Q6MZP7	749 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	WNT8B	Q93098	351 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	TAAR9	Q96RI9	348 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	NPY6R	Q99463	290 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	GPR20	Q99678	358 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	OR2AT4	A6NND4	320 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	HSPA12A	O43301	675 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	OR10H3	O60404	316 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	TXNDC12	O95881	172 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	AK1	P00568	194 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	ADA	P00813	363 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	RAP1A	P62834	184 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	ADIG	Q0VDE8	80 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	RAB40B	Q12829	278 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	FJX1	Q86VR8	437 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	BBS10	Q8TAM1	723 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	MMP26	Q9NRE1	261 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	GBF1	Q92538	1859 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	CHST10	O43529	356 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	ITGA5	P08648	1049 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	ACP2	P11117	423 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	DAO	P14920	347 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	PAX1	P15863	534 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	SCNN1A	P37088	669 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	GPR3	P46089	330 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	XCR1	P46094	333 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	LIMS1	P48059	325 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	EOGT	Q5NDL2	527 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	SP8	Q8IXZ3	490 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	CPXCR1	Q8N123	301 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	PHYHIP	Q92561	330 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	LINGO1	Q96FE5	620 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	ASB6	Q9NWX5	421 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	IL17B	Q9UHF5	180 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	ALPK3	Q96L96	1907 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351		A6NCN8	305 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	NUDT19	A8MXV4	375 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	ADAM10	O14672	748 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	HCRT	O43612	131 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	SH3BGRL	O75368	114 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	PCDH8	O95206	1070 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	RLN1	P04808	185 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	MMP10	P09238	476 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	OR4E1	P0C645	316 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	MAPK9	P45984	424 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	SLC26A5	P58743	744 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	RING1	Q06587	406 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ZNF438-208	ENST00000538351	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		7.32	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms